28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3735 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3735  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  537  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.939012 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2709  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  52.21 
 
 		 249 aa  255  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3414  membrane protein-like protein  51.63 
 
 		 263 aa  246  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00178043  hitchhiker  0.000103691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3696  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  49.21 
 
 		 253 aa  245  6e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0100204  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1263  hypothetical protein  47.1 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10091  hypothetical protein  51 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.403914  normal  0.141403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1347  hypothetical protein  51.16 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.5454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0149  hypothetical protein  29.94 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3486  membrane protein  29.66 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0117  hypothetical protein  36.9 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2700  hypothetical protein  31.58 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1221  membrane protein  38.24 
 
 		 170 aa  58.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.780478  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2680  hypothetical protein  39.44 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0072  membrane protein-like protein  26.35 
 
 		 211 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0019  membrane protein-like protein  40 
 
 		 170 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0178254  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1839  hypothetical protein  35.29 
 
 		 152 aa  52.4  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2637  membrane protein-like  41.67 
 
 		 159 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000516806  normal  0.56497 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0381  hypothetical protein  35.64 
 
 		 164 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364437  normal  0.790381 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1179  hypothetical protein  38.33 
 
 		 152 aa  50.1  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.630438  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0544  hypothetical protein  27.08 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1587  hypothetical protein  32 
 
 		 155 aa  47  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0533  hypothetical protein  30.77 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0288544 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3034  hypothetical protein  36.67 
 
 		 153 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0488  hypothetical protein  26.13 
 
 		 160 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.477591  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1854  membrane protein-like protein  29.82 
 
 		 156 aa  43.9  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.368147  hitchhiker  0.000187157 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0787  hypothetical protein  30.77 
 
 		 155 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426334  normal  0.0385246 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0553  hypothetical protein  25.23 
 
 		 160 aa  42.7  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4734  hypothetical protein  34.67 
 
 		 166 aa  42  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>