19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1263 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1263  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  598  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3735  hypothetical protein  46.76 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.939012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3696  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  45.14 
 
 		 253 aa  222  8e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0100204  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3414  membrane protein-like protein  45.67 
 
 		 263 aa  218  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00178043  hitchhiker  0.000103691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2709  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  44 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10091  hypothetical protein  45.31 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.403914  normal  0.141403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1347  hypothetical protein  41.57 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.5454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3486  membrane protein  42 
 
 		 176 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2700  hypothetical protein  29.75 
 
 		 162 aa  47  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0149  hypothetical protein  24.36 
 
 		 159 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0117  hypothetical protein  30.86 
 
 		 157 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02548  hypothetical protein  31.43 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0787  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426334  normal  0.0385246 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0488  hypothetical protein  34.67 
 
 		 160 aa  43.9  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.477591  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0381  hypothetical protein  32.98 
 
 		 164 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364437  normal  0.790381 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0553  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  42.7  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2680  hypothetical protein  38.89 
 
 		 153 aa  42.7  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4734  hypothetical protein  35.38 
 
 		 166 aa  42.7  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0544  hypothetical protein  36.23 
 
 		 207 aa  42.4  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>