27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0488 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0488  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  317  3e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.477591  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0553  hypothetical protein  98.12 
 
 
160 aa  314  2e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0787  hypothetical protein  64.94 
 
 
155 aa  204  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426334  normal  0.0385246 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02548  hypothetical protein  70.86 
 
 
156 aa  194  6e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2700  hypothetical protein  35.1 
 
 
162 aa  87  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2680  hypothetical protein  33.11 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4330  hypothetical protein  37.59 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131814  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1221  membrane protein  32.43 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.780478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2637  membrane protein-like  36.29 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000516806  normal  0.56497 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4863  hypothetical protein  34.67 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000509957  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1839  hypothetical protein  35.81 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3486  membrane protein  30.41 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3034  hypothetical protein  34.27 
 
 
153 aa  77  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0117  hypothetical protein  33.81 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0381  hypothetical protein  34.44 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364437  normal  0.790381 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2475  hypothetical protein  34.53 
 
 
143 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3792  hypothetical protein  33.11 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1179  hypothetical protein  35.14 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.630438  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0072  membrane protein-like protein  31.72 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0149  hypothetical protein  31.69 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1587  hypothetical protein  28 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0544  hypothetical protein  26.99 
 
 
207 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4734  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  62  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0533  hypothetical protein  28.3 
 
 
187 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0288544 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0019  membrane protein-like protein  29.93 
 
 
170 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0178254  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3414  membrane protein-like protein  33.33 
 
 
263 aa  50.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00178043  hitchhiker  0.000103691 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1854  membrane protein-like protein  33.33 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.368147  hitchhiker  0.000187157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>