30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0381 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0381  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  321  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364437  normal  0.790381 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4734  hypothetical protein  53.9 
 
 		 166 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2680  hypothetical protein  45.52 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0117  hypothetical protein  40.26 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3792  hypothetical protein  38.67 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4863  hypothetical protein  40.94 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000509957  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2700  hypothetical protein  35.62 
 
 		 162 aa  104  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0149  hypothetical protein  39.49 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1221  membrane protein  34.46 
 
 		 170 aa  101  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.780478  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4330  hypothetical protein  40.65 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2637  membrane protein-like  48.62 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000516806  normal  0.56497 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0072  membrane protein-like protein  35.86 
 
 		 211 aa  97.1  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1839  hypothetical protein  33.56 
 
 		 152 aa  94.7  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2475  hypothetical protein  37.04 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3034  hypothetical protein  34 
 
 		 153 aa  87.4  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0019  membrane protein-like protein  35.97 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0178254  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1587  hypothetical protein  28 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1179  hypothetical protein  35.53 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.630438  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0488  hypothetical protein  35.17 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.477591  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0553  hypothetical protein  34.48 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0787  hypothetical protein  32.39 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426334  normal  0.0385246 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3486  membrane protein  28.26 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02548  hypothetical protein  33.09 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0533  hypothetical protein  31.25 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0288544 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0544  hypothetical protein  27.74 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1854  membrane protein-like protein  42.86 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.368147  hitchhiker  0.000187157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3735  hypothetical protein  35.21 
 
 		 272 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.939012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3696  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  26.97 
 
 		 253 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0100204  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3414  membrane protein-like protein  31.17 
 
 		 263 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00178043  hitchhiker  0.000103691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2709  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  27.1 
 
 		 249 aa  41.6  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>