29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4330 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4330  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  296  8e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131814  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4863  hypothetical protein  75.34 
 
 		 154 aa  227  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000509957  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2680  hypothetical protein  53.15 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0072  membrane protein-like protein  46.05 
 
 		 211 aa  136  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0117  hypothetical protein  49.64 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2637  membrane protein-like  60.36 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000516806  normal  0.56497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0019  membrane protein-like protein  50.37 
 
 		 170 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0178254  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0149  hypothetical protein  42.75 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2700  hypothetical protein  38.93 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1839  hypothetical protein  42.22 
 
 		 152 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3792  hypothetical protein  39.86 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1221  membrane protein  39.26 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.780478  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2475  hypothetical protein  43.18 
 
 		 143 aa  103  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3034  hypothetical protein  37.96 
 
 		 153 aa  100  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3486  membrane protein  35 
 
 		 176 aa  88.6  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0381  hypothetical protein  40.65 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364437  normal  0.790381 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1179  hypothetical protein  36.11 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.630438  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4734  hypothetical protein  44.03 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1587  hypothetical protein  29.08 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0488  hypothetical protein  37.59 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.477591  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0553  hypothetical protein  37.59 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0787  hypothetical protein  33.57 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426334  normal  0.0385246 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02548  hypothetical protein  36.69 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0544  hypothetical protein  28.21 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0533  hypothetical protein  37.31 
 
 		 187 aa  50.8  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0288544 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1854  membrane protein-like protein  42.86 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.368147  hitchhiker  0.000187157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3696  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  27.15 
 
 		 253 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0100204  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3414  membrane protein-like protein  32.79 
 
 		 263 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00178043  hitchhiker  0.000103691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2709  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  31.18 
 
 		 249 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>