32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0149 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0149  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  317  5e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0117  hypothetical protein  51.95 
 
 
157 aa  166  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2680  hypothetical protein  47.18 
 
 
153 aa  142  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1221  membrane protein  45.65 
 
 
170 aa  140  9e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.780478  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2700  hypothetical protein  44.59 
 
 
162 aa  137  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2637  membrane protein-like  51.22 
 
 
159 aa  130  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000516806  normal  0.56497 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0072  membrane protein-like protein  42.25 
 
 
211 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1839  hypothetical protein  46.48 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4863  hypothetical protein  45.19 
 
 
154 aa  124  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000509957  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4330  hypothetical protein  42.75 
 
 
153 aa  121  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131814  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3034  hypothetical protein  40.97 
 
 
153 aa  117  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0019  membrane protein-like protein  43.48 
 
 
170 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0178254  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2475  hypothetical protein  41.13 
 
 
143 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3792  hypothetical protein  38.62 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3486  membrane protein  38.81 
 
 
176 aa  99  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1179  hypothetical protein  44.44 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.630438  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4734  hypothetical protein  38.52 
 
 
166 aa  91.3  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1587  hypothetical protein  29.68 
 
 
155 aa  90.5  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0381  hypothetical protein  39.49 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364437  normal  0.790381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2709  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  40.57 
 
 
249 aa  74.7  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0787  hypothetical protein  30.3 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426334  normal  0.0385246 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0553  hypothetical protein  31.21 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0488  hypothetical protein  31.21 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.477591  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02548  hypothetical protein  32.37 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3414  membrane protein-like protein  29.38 
 
 
263 aa  62.4  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00178043  hitchhiker  0.000103691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3696  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  36.14 
 
 
253 aa  61.6  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0100204  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3735  hypothetical protein  36.62 
 
 
272 aa  60.8  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.939012 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0544  hypothetical protein  31.25 
 
 
207 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0533  hypothetical protein  31.21 
 
 
187 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0288544 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10091  hypothetical protein  32.14 
 
 
256 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.403914  normal  0.141403 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1854  membrane protein-like protein  42.86 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.368147  hitchhiker  0.000187157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1347  hypothetical protein  44.74 
 
 
268 aa  40.8  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.5454  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>