28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4863 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4863  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  301  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000509957  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4330  hypothetical protein  75.34 
 
 		 153 aa  227  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131814  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0117  hypothetical protein  51.08 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2680  hypothetical protein  46.31 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0072  membrane protein-like protein  47.22 
 
 		 211 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2637  membrane protein-like  56.76 
 
 		 159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000516806  normal  0.56497 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0149  hypothetical protein  45.19 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2700  hypothetical protein  41.67 
 
 		 162 aa  120  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0019  membrane protein-like protein  45.59 
 
 		 170 aa  120  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0178254  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1221  membrane protein  41.1 
 
 		 170 aa  118  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.780478  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3792  hypothetical protein  41.96 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1839  hypothetical protein  39.86 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2475  hypothetical protein  40.74 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3034  hypothetical protein  37.06 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3486  membrane protein  33.82 
 
 		 176 aa  88.2  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0381  hypothetical protein  40.94 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364437  normal  0.790381 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4734  hypothetical protein  45.65 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1587  hypothetical protein  29.37 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1179  hypothetical protein  33.56 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.630438  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0488  hypothetical protein  35.33 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.477591  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0553  hypothetical protein  34 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0787  hypothetical protein  34.27 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426334  normal  0.0385246 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02548  hypothetical protein  36.69 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0544  hypothetical protein  30 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0533  hypothetical protein  28.3 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0288544 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2709  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  33.7 
 
 		 249 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1854  membrane protein-like protein  52.38 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.368147  hitchhiker  0.000187157 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3414  membrane protein-like protein  33.87 
 
 		 263 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00178043  hitchhiker  0.000103691 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>