31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3414 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3414  membrane protein-like protein  100 
 
 		 263 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00178043  hitchhiker  0.000103691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3696  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  61.04 
 
 		 253 aa  308  4e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0100204  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2709  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  57.26 
 
 		 249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3735  hypothetical protein  49.81 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.939012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1263  hypothetical protein  45.56 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10091  hypothetical protein  44.18 
 
 		 256 aa  182  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.403914  normal  0.141403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1347  hypothetical protein  44.75 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.5454  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0117  hypothetical protein  30.67 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3486  membrane protein  28.57 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0019  membrane protein-like protein  43.28 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0178254  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0149  hypothetical protein  29.38 
 
 		 159 aa  62  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4734  hypothetical protein  32.29 
 
 		 166 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0072  membrane protein-like protein  34.29 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0544  hypothetical protein  37.68 
 
 		 207 aa  52.8  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2680  hypothetical protein  39.71 
 
 		 153 aa  52.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1839  hypothetical protein  25.3 
 
 		 152 aa  51.6  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1179  hypothetical protein  32 
 
 		 152 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.630438  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2700  hypothetical protein  29.76 
 
 		 162 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0533  hypothetical protein  38.46 
 
 		 187 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0288544 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1221  membrane protein  26.19 
 
 		 170 aa  50.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.780478  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0553  hypothetical protein  32.86 
 
 		 160 aa  50.1  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0488  hypothetical protein  32.86 
 
 		 160 aa  49.3  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.477591  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2475  hypothetical protein  39.66 
 
 		 143 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2637  membrane protein-like  36.07 
 
 		 159 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000516806  normal  0.56497 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0787  hypothetical protein  26.39 
 
 		 155 aa  46.6  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426334  normal  0.0385246 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02548  hypothetical protein  26.39 
 
 		 156 aa  45.8  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4863  hypothetical protein  33.87 
 
 		 154 aa  45.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000509957  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3792  hypothetical protein  38.18 
 
 		 156 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3034  hypothetical protein  30.99 
 
 		 153 aa  43.5  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1854  membrane protein-like protein  36.21 
 
 		 156 aa  43.5  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.368147  hitchhiker  0.000187157 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4330  hypothetical protein  32.79 
 
 		 153 aa  42  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>