30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3034 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3034  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  306  5e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1179  hypothetical protein  56.76 
 
 		 152 aa  164  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.630438  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2700  hypothetical protein  47.97 
 
 		 162 aa  153  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1839  hypothetical protein  50.34 
 
 		 152 aa  153  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1221  membrane protein  45.81 
 
 		 170 aa  150  8.999999999999999e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.780478  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1587  hypothetical protein  41.55 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0149  hypothetical protein  40.97 
 
 		 159 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2680  hypothetical protein  38.69 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0019  membrane protein-like protein  42.22 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0178254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2637  membrane protein-like  46.9 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000516806  normal  0.56497 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0117  hypothetical protein  39.07 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0072  membrane protein-like protein  37.67 
 
 		 211 aa  106  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3486  membrane protein  33.33 
 
 		 176 aa  103  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3792  hypothetical protein  38 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4330  hypothetical protein  37.96 
 
 		 153 aa  100  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131814  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2475  hypothetical protein  37.14 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4863  hypothetical protein  37.06 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000509957  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0381  hypothetical protein  34 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364437  normal  0.790381 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0787  hypothetical protein  29.17 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426334  normal  0.0385246 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4734  hypothetical protein  32.41 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02548  hypothetical protein  35.25 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0544  hypothetical protein  31.01 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0553  hypothetical protein  35.66 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0488  hypothetical protein  34.27 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.477591  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2709  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  31.87 
 
 		 249 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0533  hypothetical protein  29.11 
 
 		 187 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0288544 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1854  membrane protein-like protein  41.27 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.368147  hitchhiker  0.000187157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3696  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  31.87 
 
 		 253 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0100204  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3735  hypothetical protein  36.67 
 
 		 272 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.939012 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3414  membrane protein-like protein  30.99 
 
 		 263 aa  44.3  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00178043  hitchhiker  0.000103691 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>