31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1839 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1839  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  302  9.000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2700  hypothetical protein  53.02 
 
 		 162 aa  173  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1221  membrane protein  51.03 
 
 		 170 aa  155  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.780478  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3034  hypothetical protein  50.34 
 
 		 153 aa  153  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1179  hypothetical protein  51.32 
 
 		 152 aa  141  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.630438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0019  membrane protein-like protein  48.25 
 
 		 170 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0178254  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0072  membrane protein-like protein  44.6 
 
 		 211 aa  128  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0149  hypothetical protein  46.48 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0117  hypothetical protein  45.71 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2680  hypothetical protein  43.94 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1587  hypothetical protein  39.57 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2637  membrane protein-like  47.46 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000516806  normal  0.56497 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4330  hypothetical protein  42.22 
 
 		 153 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131814  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2475  hypothetical protein  39.13 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4863  hypothetical protein  39.86 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000509957  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3792  hypothetical protein  38.19 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3486  membrane protein  35 
 
 		 176 aa  98.2  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0381  hypothetical protein  33.56 
 
 		 164 aa  90.9  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364437  normal  0.790381 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0787  hypothetical protein  35.81 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426334  normal  0.0385246 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4734  hypothetical protein  34.04 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0553  hypothetical protein  35.81 
 
 		 160 aa  72  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02548  hypothetical protein  37.88 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0488  hypothetical protein  35.81 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.477591  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0544  hypothetical protein  32.67 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0533  hypothetical protein  28.76 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0288544 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2709  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  32.89 
 
 		 249 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3696  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  35 
 
 		 253 aa  57.8  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0100204  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3735  hypothetical protein  35 
 
 		 272 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.939012 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3414  membrane protein-like protein  25.3 
 
 		 263 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00178043  hitchhiker  0.000103691 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10091  hypothetical protein  28.95 
 
 		 256 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.403914  normal  0.141403 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1854  membrane protein-like protein  44.68 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.368147  hitchhiker  0.000187157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>