31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3486 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3486  membrane protein  100 
 
 
176 aa  354  2.9999999999999997e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0072  membrane protein-like protein  35.5 
 
 
211 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3034  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0149  hypothetical protein  38.81 
 
 
159 aa  99  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1221  membrane protein  33.56 
 
 
170 aa  98.6  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.780478  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1839  hypothetical protein  35 
 
 
152 aa  98.2  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2700  hypothetical protein  32.05 
 
 
162 aa  96.7  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3792  hypothetical protein  36.43 
 
 
156 aa  91.3  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0117  hypothetical protein  32.19 
 
 
157 aa  90.9  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4330  hypothetical protein  35 
 
 
153 aa  88.6  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131814  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4863  hypothetical protein  33.82 
 
 
154 aa  88.2  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000509957  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2680  hypothetical protein  35.53 
 
 
153 aa  87.8  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1587  hypothetical protein  30 
 
 
155 aa  87  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0019  membrane protein-like protein  32.86 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0178254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2637  membrane protein-like  37.19 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000516806  normal  0.56497 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1179  hypothetical protein  38.24 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.630438  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02548  hypothetical protein  32.87 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4734  hypothetical protein  30.72 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0553  hypothetical protein  30.41 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0787  hypothetical protein  29.93 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426334  normal  0.0385246 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0488  hypothetical protein  30.41 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.477591  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2475  hypothetical protein  30.83 
 
 
143 aa  72  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3414  membrane protein-like protein  28.57 
 
 
263 aa  65.1  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00178043  hitchhiker  0.000103691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0381  hypothetical protein  28.26 
 
 
164 aa  61.6  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364437  normal  0.790381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2709  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  34.31 
 
 
249 aa  60.5  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3735  hypothetical protein  29.66 
 
 
272 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.939012 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10091  hypothetical protein  35.62 
 
 
256 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.403914  normal  0.141403 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0544  hypothetical protein  24.24 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3696  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  35.29 
 
 
253 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0100204  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0533  hypothetical protein  25 
 
 
187 aa  48.9  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0288544 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1854  membrane protein-like protein  30.43 
 
 
156 aa  45.8  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.368147  hitchhiker  0.000187157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>