28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02548 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02548  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  303  8.000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0787  hypothetical protein  74.84 
 
 		 155 aa  236  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426334  normal  0.0385246 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0553  hypothetical protein  71.43 
 
 		 160 aa  203  8e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0488  hypothetical protein  71.43 
 
 		 160 aa  201  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.477591  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2700  hypothetical protein  34.25 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0117  hypothetical protein  38.85 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1221  membrane protein  31.51 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.780478  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3034  hypothetical protein  35.25 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3486  membrane protein  32.87 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1839  hypothetical protein  37.06 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4863  hypothetical protein  36.36 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000509957  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2680  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4330  hypothetical protein  35.86 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3792  hypothetical protein  34.9 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4734  hypothetical protein  38.67 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1179  hypothetical protein  34.01 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.630438  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2475  hypothetical protein  34.33 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2637  membrane protein-like  34.43 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000516806  normal  0.56497 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0381  hypothetical protein  34.27 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364437  normal  0.790381 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0072  membrane protein-like protein  29.87 
 
 		 211 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1587  hypothetical protein  27.59 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0149  hypothetical protein  32.37 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0019  membrane protein-like protein  31.88 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0178254  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0544  hypothetical protein  26.99 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0533  hypothetical protein  29.7 
 
 		 187 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0288544 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3414  membrane protein-like protein  26.39 
 
 		 263 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00178043  hitchhiker  0.000103691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2709  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  36.17 
 
 		 249 aa  42.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10091  hypothetical protein  28.17 
 
 		 256 aa  42  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.403914  normal  0.141403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>