135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1267 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0172  translation initiation factor Sui1  100 
 
 		 102 aa  202  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0000141332  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0651  translation initiation factor Sui1  100 
 
 		 102 aa  202  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000000000433453  decreased coverage  0.0000613351 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1267  translation initiation factor Sui1  100 
 
 		 102 aa  202  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000000776224  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0717  translation initiation factor Sui1  98.04 
 
 		 107 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00154405  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1391  translation initiation factor Sui1  87.25 
 
 		 113 aa  185  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0534  translation initiation factor Sui1  55.21 
 
 		 102 aa  121  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2049  translation initiation factor Sui1  54.64 
 
 		 102 aa  120  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  9.06796e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0321  translation initiation factor Sui1  58.76 
 
 		 101 aa  120  9e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1990  translation initiation factor Sui1  58.76 
 
 		 101 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1902  translation initiation factor Sui1  56.7 
 
 		 101 aa  117  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1997  translation initiation factor Sui1  53.61 
 
 		 101 aa  114  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2911  translation initiation factor Sui1  56.25 
 
 		 101 aa  114  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0366  translation initiation factor Sui1  52 
 
 		 102 aa  107  6e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.485747  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3580  translation initiation factor SUI1  48.42 
 
 		 97 aa  102  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0627  translation initiation factor Sui1  47.37 
 
 		 97 aa  101  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.344568  normal  0.0369514 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2534  translation initiation factor Sui1  47.37 
 
 		 97 aa  100  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1589  translation initiation factor SUI1  47.37 
 
 		 97 aa  100  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0210  translation initiation factor SUI1  48.94 
 
 		 98 aa  97.4  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2078  translation initiation factor Sui1  48.42 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.157753  normal  0.161852 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0622  translation initiation factor SUI1  45.1 
 
 		 102 aa  93.6  7e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1423  translation initiation factor SUI1  47.31 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2210  translation initiation factor Sui1  49.46 
 
 		 99 aa  85.5  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000269686 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0760  translation initiation factor SUI1  43.3 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0438  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  38.38 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3343  translation initiation factor Sui1  41.1 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1754  translation initiation factor SUI1  36.36 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000000113267  hitchhiker  0.00210388 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1574  translation initiation factor SUI1  36.36 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1910  translation initiation factor Sui1  42.86 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3188  translation initiation factor SUI1  38.27 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00588203  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0584  translation initiation factor SUI1  35.35 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00019387 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3941  translation initiation factor SUI1  41.79 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0505  translation initiation factor SUI1  40.24 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.583781  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3853  translation initiation factor SUI1  34.44 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2964  translation initiation factor Sui1  36.25 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2806  translation initiation factor Sui1  36.46 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3154  translation initiation factor Sui1  36.25 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2059  translation initiation factor SUI1  38.54 
 
 		 120 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5669  translation initiation factor SUI1  38.54 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4810  translation initiation factor Sui1  37.66 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2580  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  45.31 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2075  translation initiation factor SUI1  39.44 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3549  translation initiation factor SUI1  37.5 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0680444 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3637  translation initiation factor SUI1  36.84 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2203  translation initiation factor SUI1  40.43 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.513989 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0413  translation initiation factor Sui1  39.58 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1480  translation initiation factor Sui1  38.54 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2734  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  37 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0691  translation initiation factor Sui1  37.89 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402227  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2142  translation initiation factor Sui1  43.94 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.183879  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0267  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  39.08 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2854  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  41.03 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339586  normal  0.0877983 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4188  translation initiation factor SUI1  42.31 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4841  translation initiation factor SUI1, putative  38.71 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0413  translation initiation factor Sui1  38.54 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1532  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  46.55 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02391  translation initiation factor SUI1  46.55 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0726  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  38.3 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0343  translation initiation factor Sui1  38.37 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000865275  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0611  translation initiation factor Sui1  39.78 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649934 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1443  translation initiation factor SUI1  36 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00199904  normal  0.134693 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4380  translation initiation factor Sui1  38.71 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07040  translation initiation factor Sui1  38.71 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0605  translation initiation factor SUI1  39.78 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0636  translation initiation factor Sui1  45.31 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171454  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0566  translation initiation factor Sui1  39.78 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1757  translation initiation factor SUI1  38.54 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64000  translation initiation factor Sui1  35.48 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0321  translation initiation factor SUI1  38.78 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1504  translation initiation factor SUI1  45.16 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5560  translation initiation factor Sui1  35.48 
 
 		 123 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05783  translation initiation factor Sui1  46.88 
 
 		 103 aa  52.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4599  translation initiation factor Sui1  37.63 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0471  translation initiation factor SUI1  36.25 
 
 		 110 aa  52  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2675  translation initiation factor Sui1  47.62 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000045449  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2865  translation initiation factor SUI1  41.46 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000152  translation initiation factor SUI1-related protein  46.88 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2851  translation initiation factor Sui1  43.75 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181646  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2471  translation initiation factor Sui1  39.74 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.827071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0024  translation initiation factor SUI1  26 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.178151  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1145  translation initiation factor Sui1  42.19 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.244875  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3595  translation initiation factor SUI1  36.62 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52235  normal  0.025407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0626  translation initiation factor Sui1  35.48 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1592  translation initiation factor SUI1  43.75 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2419  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  40 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1185  translation initiation factor SUI1  40.32 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00309802  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1238  translation initiation factor Sui1  39.68 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.120876 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1133  translation initiation factor Sui1  40.62 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129077  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3345  translation initiation factor Sui1  41.27 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1201  translation initiation factor Sui1  41.27 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0177618  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1568  translation initiation factor Sui1  41.27 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1338  translation initiation factor Sui1  41.27 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0446445  hitchhiker  0.000386966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1200  translation initiation factor Sui1  41.27 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000764802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2838  translation initiation factor SUI1  35.48 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.179746  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0563  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  46 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1271  translation initiation factor Sui1  41.27 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000428708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2680  translation initiation factor Sui1  39.68 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0972  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  39.68 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017895  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3018  translation initiation factor Sui1  38.1 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000751139  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3033  translation initiation factor Sui1  38.1 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000199492  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1345  translation initiation factor Sui1  38.1 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00294429  hitchhiker  0.000000000546863 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>