135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1423 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1423  translation initiation factor SUI1  100 
 
 		 100 aa  195  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2210  translation initiation factor Sui1  77 
 
 		 99 aa  162  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000269686 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1997  translation initiation factor Sui1  51.65 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1990  translation initiation factor Sui1  51.65 
 
 		 101 aa  95.1  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0505  translation initiation factor SUI1  47.92 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.583781  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0366  translation initiation factor Sui1  47 
 
 		 102 aa  93.6  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.485747  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2911  translation initiation factor Sui1  51.65 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1902  translation initiation factor Sui1  51.65 
 
 		 101 aa  92.8  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2049  translation initiation factor Sui1  43 
 
 		 102 aa  92  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  9.06796e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0210  translation initiation factor SUI1  52.22 
 
 		 98 aa  91.3  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0534  translation initiation factor Sui1  42 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0321  translation initiation factor Sui1  47.25 
 
 		 101 aa  88.6  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0627  translation initiation factor Sui1  48.84 
 
 		 97 aa  89.4  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.344568  normal  0.0369514 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2534  translation initiation factor Sui1  48.84 
 
 		 97 aa  88.6  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0717  translation initiation factor Sui1  48.39 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00154405  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1391  translation initiation factor Sui1  48.35 
 
 		 113 aa  87  7e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0172  translation initiation factor Sui1  47.31 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0000141332  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0651  translation initiation factor Sui1  47.31 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000000000433453  decreased coverage  0.0000613351 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1267  translation initiation factor Sui1  47.31 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000000776224  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1589  translation initiation factor SUI1  46.51 
 
 		 97 aa  86.3  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3580  translation initiation factor SUI1  45.35 
 
 		 97 aa  83.6  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0622  translation initiation factor SUI1  45.26 
 
 		 102 aa  84  7e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0760  translation initiation factor SUI1  49.45 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1574  translation initiation factor SUI1  44.44 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2075  translation initiation factor SUI1  49.33 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0438  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  43.43 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0584  translation initiation factor SUI1  43.43 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00019387 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3637  translation initiation factor SUI1  46.67 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1754  translation initiation factor SUI1  43.96 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000000113267  hitchhiker  0.00210388 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2078  translation initiation factor Sui1  47.67 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.157753  normal  0.161852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0471  translation initiation factor SUI1  46.34 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3343  translation initiation factor Sui1  42.86 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1504  translation initiation factor SUI1  39.76 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2838  translation initiation factor SUI1  47.14 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.179746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3941  translation initiation factor SUI1  38.75 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1910  translation initiation factor Sui1  41.56 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4810  translation initiation factor Sui1  38.96 
 
 		 116 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2854  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  41.03 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339586  normal  0.0877983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4092  translation initiation factor SUI1  42.86 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0248  translation initation factor SUI1, putative  40.74 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3188  translation initiation factor SUI1  40.45 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00588203  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0636  translation initiation factor Sui1  50.79 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171454  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3154  translation initiation factor Sui1  38.16 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2964  translation initiation factor Sui1  38.16 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3853  translation initiation factor SUI1  36.36 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10953  putative translation initiation factor  43.08 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.788012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0343  translation initiation factor Sui1  48.48 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000865275  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3549  translation initiation factor SUI1  46.77 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0680444 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2203  translation initiation factor SUI1  42.86 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.513989 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01715  Sui1 family protein  50 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2675  translation initiation factor Sui1  37.35 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000045449  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5669  translation initiation factor SUI1  36.36 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2734  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  44.44 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1912  translation initiation factor Sui1  49.09 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000470884  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1238  translation initiation factor Sui1  46.15 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.120876 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2237  translation initiation factor Sui1  49.09 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0294222  normal  0.0125302 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2023  translation initiation factor Sui1  49.09 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.785803  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2186  translation initiation factor Sui1  38.96 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.019439  hitchhiker  0.000338309 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0972  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  45 
 
 		 105 aa  52.8  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017895  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2865  translation initiation factor SUI1  37.5 
 
 		 119 aa  52.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2059  translation initiation factor SUI1  35.71 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3595  translation initiation factor SUI1  37.35 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52235  normal  0.025407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1568  translation initiation factor Sui1  41.94 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2142  translation initiation factor Sui1  43.75 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.183879  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2580  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  42.86 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1145  translation initiation factor Sui1  44.62 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.244875  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2680  translation initiation factor Sui1  37.35 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1133  translation initiation factor Sui1  42.86 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129077  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1917  translation initiation factor Sui1  40.26 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000003145  hitchhiker  0.00000000000000420932 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000152  translation initiation factor SUI1-related protein  47.62 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2806  translation initiation factor Sui1  37.35 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2646  translation initiation factor Sui1  37.18 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000146872  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0691  translation initiation factor Sui1  37.5 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402227  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3345  translation initiation factor Sui1  43.55 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0413  translation initiation factor Sui1  41.67 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1201  translation initiation factor Sui1  43.55 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0177618  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05783  translation initiation factor Sui1  47.62 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01259  translation initiation factor Sui1  49.09 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000686676  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2365  translation initiation factor SUI1  49.09 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110904  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01270  hypothetical protein  49.09 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000544894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1394  translation initiation factor Sui1  49.09 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000598621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1485  translation initiation factor Sui1  49.09 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305323  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2344  translation initiation factor Sui1  49.09 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000454927  unclonable  0.000000015805 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1511  translation initiation factor Sui1  49.09 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000972273  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1830  translation initiation factor Sui1  49.09 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0277649  hitchhiker  8.595610000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1892  translation initiation factor Sui1  49.09 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000000000000626787 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1835  translation initiation factor Sui1  49.09 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00136333  hitchhiker  0.000244384 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1443  translation initiation factor Sui1  49.09 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1625  translation initiation factor Sui1  49.09 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00194965  hitchhiker  4.78145e-19 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3018  translation initiation factor Sui1  44.44 
 
 		 112 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000751139  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3033  translation initiation factor Sui1  44.44 
 
 		 112 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000199492  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3176  translation initiation factor Sui1  44.44 
 
 		 112 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00012053  hitchhiker  0.0057416 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1846  translation initiation factor Sui1  49.09 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000134227  hitchhiker  8.5212e-20 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1345  translation initiation factor Sui1  44.44 
 
 		 112 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00294429  hitchhiker  0.000000000546863 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1480  translation initiation factor Sui1  44.44 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0267  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  37.18 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1592  translation initiation factor SUI1  42.25 
 
 		 106 aa  50.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0626  translation initiation factor Sui1  39.02 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1704  translation initiation factor SUI1  47.27 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00246322  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2195  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  44.44 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0976146  normal  0.851363 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>