145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0321 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0321  translation initiation factor Sui1  100 
 
 
101 aa  205  2e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1997  translation initiation factor Sui1  80.2 
 
 
101 aa  176  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1902  translation initiation factor Sui1  82.18 
 
 
101 aa  172  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1990  translation initiation factor Sui1  79.21 
 
 
101 aa  170  7.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2911  translation initiation factor Sui1  78.22 
 
 
101 aa  167  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0534  translation initiation factor Sui1  69 
 
 
102 aa  150  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0366  translation initiation factor Sui1  67.33 
 
 
102 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.485747  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2049  translation initiation factor Sui1  67 
 
 
102 aa  144  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  9.06796e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3580  translation initiation factor SUI1  53.68 
 
 
97 aa  122  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0717  translation initiation factor Sui1  58.76 
 
 
107 aa  121  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00154405  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0627  translation initiation factor Sui1  52.63 
 
 
97 aa  120  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.344568  normal  0.0369514 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1589  translation initiation factor SUI1  53.68 
 
 
97 aa  121  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2534  translation initiation factor Sui1  52.63 
 
 
97 aa  120  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0172  translation initiation factor Sui1  58.76 
 
 
102 aa  120  9e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0000141332  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0651  translation initiation factor Sui1  58.76 
 
 
102 aa  120  9e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000000000433453  decreased coverage  0.0000613351 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1267  translation initiation factor Sui1  58.76 
 
 
102 aa  120  9e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000000776224  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1391  translation initiation factor Sui1  57.73 
 
 
113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2078  translation initiation factor Sui1  54.74 
 
 
97 aa  113  7.999999999999999e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.157753  normal  0.161852 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0210  translation initiation factor SUI1  48.39 
 
 
98 aa  103  9e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0622  translation initiation factor SUI1  47.92 
 
 
102 aa  98.2  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1423  translation initiation factor SUI1  47.25 
 
 
100 aa  88.6  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2210  translation initiation factor Sui1  50.55 
 
 
99 aa  87.4  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000269686 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0760  translation initiation factor SUI1  45.98 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0505  translation initiation factor SUI1  41.67 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.583781  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2075  translation initiation factor SUI1  45.95 
 
 
98 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3637  translation initiation factor SUI1  41.03 
 
 
98 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0438  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  37.89 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2806  translation initiation factor Sui1  38.78 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297006  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1754  translation initiation factor SUI1  34.74 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000000113267  hitchhiker  0.00210388 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0267  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  38.38 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1574  translation initiation factor SUI1  37.5 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0584  translation initiation factor SUI1  34.74 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00019387 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3941  translation initiation factor SUI1  42.86 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3853  translation initiation factor SUI1  40 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0413  translation initiation factor Sui1  41.67 
 
 
122 aa  62.8  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0413  translation initiation factor Sui1  41.67 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0691  translation initiation factor Sui1  38.95 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0343  translation initiation factor Sui1  39.8 
 
 
121 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000865275  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1443  translation initiation factor SUI1  37.86 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00199904  normal  0.134693 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2865  translation initiation factor SUI1  35.05 
 
 
119 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1480  translation initiation factor Sui1  36.36 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2059  translation initiation factor SUI1  40.21 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0726  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  36.17 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3549  translation initiation factor SUI1  35.29 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0680444 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4380  translation initiation factor Sui1  37.63 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830208  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3154  translation initiation factor Sui1  40 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2854  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  41.98 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339586  normal  0.0877983 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2964  translation initiation factor Sui1  40 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4841  translation initiation factor SUI1, putative  36.56 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0611  translation initiation factor Sui1  37.63 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0649934 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1627  translation initiation factor SUI1  41.05 
 
 
113 aa  57.4  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5669  translation initiation factor SUI1  38.14 
 
 
120 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1504  translation initiation factor SUI1  42.42 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4810  translation initiation factor Sui1  38.96 
 
 
116 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0626  translation initiation factor Sui1  35.48 
 
 
123 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0566  translation initiation factor Sui1  36.56 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0248  translation initation factor SUI1, putative  40.24 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1910  translation initiation factor Sui1  40.26 
 
 
115 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1757  translation initiation factor SUI1  44.21 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2734  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  38.38 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3343  translation initiation factor Sui1  41.67 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07040  translation initiation factor Sui1  39.78 
 
 
123 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0321  translation initiation factor SUI1  39.39 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3188  translation initiation factor SUI1  35.8 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00588203  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0605  translation initiation factor SUI1  36.56 
 
 
184 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2838  translation initiation factor SUI1  30.34 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.179746  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5560  translation initiation factor Sui1  37.63 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01715  Sui1 family protein  42.42 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2203  translation initiation factor SUI1  36.17 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.513989 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4599  translation initiation factor Sui1  35.48 
 
 
123 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3595  translation initiation factor SUI1  42.25 
 
 
112 aa  54.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52235  normal  0.025407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64000  translation initiation factor Sui1  36.56 
 
 
123 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0471  translation initiation factor SUI1  39.24 
 
 
110 aa  53.9  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2419  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  41.77 
 
 
108 aa  53.9  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1912  translation initiation factor Sui1  40.28 
 
 
108 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000470884  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2237  translation initiation factor Sui1  40.28 
 
 
108 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0294222  normal  0.0125302 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2023  translation initiation factor Sui1  40.28 
 
 
108 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.785803  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1133  translation initiation factor Sui1  43.94 
 
 
109 aa  53.9  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129077  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0636  translation initiation factor Sui1  39.39 
 
 
103 aa  53.5  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171454  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2580  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  40.91 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2364  translation initiation factor Sui1  41.67 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0271288  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1200  translation initiation factor Sui1  42.42 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000764802  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1338  translation initiation factor Sui1  44.12 
 
 
109 aa  52.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0446445  hitchhiker  0.000386966 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2675  translation initiation factor Sui1  44.12 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000045449  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2639  translation initiation factor Sui1  41.67 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000116235  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0563  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  42.42 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05783  translation initiation factor Sui1  42.42 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000152  translation initiation factor SUI1-related protein  42.42 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3345  translation initiation factor Sui1  42.42 
 
 
109 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1201  translation initiation factor Sui1  42.42 
 
 
109 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0177618  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1145  translation initiation factor Sui1  44.12 
 
 
109 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.244875  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2186  translation initiation factor Sui1  38.89 
 
 
108 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.019439  hitchhiker  0.000338309 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2680  translation initiation factor Sui1  40.91 
 
 
109 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1271  translation initiation factor Sui1  42.42 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000428708  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2851  translation initiation factor Sui1  41.18 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181646  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1238  translation initiation factor Sui1  42.65 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.120876 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1443  translation initiation factor Sui1  38.89 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1625  translation initiation factor Sui1  38.89 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00194965  hitchhiker  4.78145e-19 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1835  translation initiation factor Sui1  38.89 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00136333  hitchhiker  0.000244384 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1830  translation initiation factor Sui1  38.89 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0277649  hitchhiker  8.595610000000001e-28 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>