141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10953 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_10953  putative translation initiation factor  100 
 
 
109 aa  221  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.788012  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2838  translation initiation factor SUI1  62.73 
 
 
110 aa  143  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.179746  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1504  translation initiation factor SUI1  62.39 
 
 
107 aa  143  9e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0471  translation initiation factor SUI1  47.69 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2854  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  38.2 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339586  normal  0.0877983 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2075  translation initiation factor SUI1  42.25 
 
 
98 aa  64.7  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4092  translation initiation factor SUI1  38.46 
 
 
117 aa  62.8  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3637  translation initiation factor SUI1  40.85 
 
 
98 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2142  translation initiation factor Sui1  41.03 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.183879  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1757  translation initiation factor SUI1  41.79 
 
 
120 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4841  translation initiation factor SUI1, putative  49.25 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2195  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  33.98 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0976146  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2203  translation initiation factor SUI1  44.78 
 
 
114 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.513989 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4810  translation initiation factor Sui1  40.3 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3343  translation initiation factor Sui1  38.81 
 
 
122 aa  57  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1480  translation initiation factor Sui1  44.78 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2580  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  40.3 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0267  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  43.28 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2964  translation initiation factor Sui1  40.3 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3154  translation initiation factor Sui1  40.3 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1912  translation initiation factor Sui1  47.76 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000470884  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3595  translation initiation factor SUI1  40.62 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52235  normal  0.025407 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2237  translation initiation factor Sui1  47.76 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0294222  normal  0.0125302 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2023  translation initiation factor Sui1  47.76 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.785803  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0627  translation initiation factor Sui1  42.19 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.344568  normal  0.0369514 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1423  translation initiation factor SUI1  43.08 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1443  translation initiation factor SUI1  43.28 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00199904  normal  0.134693 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3580  translation initiation factor SUI1  40.62 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0760  translation initiation factor SUI1  37.18 
 
 
121 aa  55.5  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2534  translation initiation factor Sui1  42.19 
 
 
97 aa  55.5  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3853  translation initiation factor SUI1  35.82 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0726  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  43.28 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4380  translation initiation factor Sui1  46.27 
 
 
123 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830208  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3188  translation initiation factor SUI1  40.3 
 
 
118 aa  55.1  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00588203  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0248  translation initation factor SUI1, putative  34.41 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3941  translation initiation factor SUI1  41.54 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2734  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  40.3 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0343  translation initiation factor Sui1  41.79 
 
 
121 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000865275  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1589  translation initiation factor SUI1  39.06 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3549  translation initiation factor SUI1  38.81 
 
 
120 aa  52.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0680444 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0691  translation initiation factor Sui1  38.81 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402227  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1910  translation initiation factor Sui1  32.29 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0972  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  41.79 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017895  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0584  translation initiation factor SUI1  42.11 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00019387 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2865  translation initiation factor SUI1  41.79 
 
 
119 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1568  translation initiation factor Sui1  38.81 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1754  translation initiation factor SUI1  43.24 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000000113267  hitchhiker  0.00210388 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01715  Sui1 family protein  41.79 
 
 
110 aa  52  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1574  translation initiation factor SUI1  41.89 
 
 
128 aa  52  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4188  translation initiation factor SUI1  40.98 
 
 
141 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2059  translation initiation factor SUI1  38.81 
 
 
120 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2210  translation initiation factor Sui1  46.15 
 
 
99 aa  51.2  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000269686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0321  translation initiation factor SUI1  40.3 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27071  translation initiation factor SUI1  41.79 
 
 
113 aa  50.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000152  translation initiation factor SUI1-related protein  46.27 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0438  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  39.47 
 
 
120 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4512  translation initiation factor SUI1  41.67 
 
 
112 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.477068  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05783  translation initiation factor Sui1  46.27 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0626  translation initiation factor Sui1  43.28 
 
 
123 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64000  translation initiation factor Sui1  41.79 
 
 
123 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2911  translation initiation factor Sui1  37.14 
 
 
101 aa  50.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1997  translation initiation factor Sui1  39.34 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5560  translation initiation factor Sui1  41.79 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2806  translation initiation factor Sui1  38.81 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297006  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1990  translation initiation factor Sui1  39.34 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0505  translation initiation factor SUI1  29.21 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.583781  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2471  translation initiation factor Sui1  41.79 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.827071  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1163  translation initiation factor SUI1  45.45 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0953729  normal  0.11202 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0563  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  38.81 
 
 
83 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2186  translation initiation factor Sui1  43.28 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.019439  hitchhiker  0.000338309 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1737  translation initiation factor SUI1  41.79 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084137  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1627  translation initiation factor SUI1  33.33 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1509  translation initiation factor SUI1  31.52 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.920781  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0605  translation initiation factor SUI1  38.81 
 
 
184 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0062  translation initiation factor SUI1  39.58 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2646  translation initiation factor Sui1  43.28 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000146872  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1830  translation initiation factor Sui1  41.79 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0277649  hitchhiker  8.595610000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1892  translation initiation factor Sui1  41.79 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000000000000626787 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1835  translation initiation factor Sui1  41.79 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00136333  hitchhiker  0.000244384 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1625  translation initiation factor Sui1  41.79 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00194965  hitchhiker  4.78145e-19 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1443  translation initiation factor Sui1  41.79 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1185  translation initiation factor SUI1  38.81 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00309802  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0321  translation initiation factor Sui1  34.29 
 
 
101 aa  47.8  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01259  translation initiation factor Sui1  41.79 
 
 
108 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000686676  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2365  translation initiation factor SUI1  41.79 
 
 
108 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110904  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0566  translation initiation factor Sui1  38.81 
 
 
123 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0534  translation initiation factor Sui1  27.27 
 
 
102 aa  47.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1592  translation initiation factor SUI1  41.79 
 
 
106 aa  47.4  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01270  hypothetical protein  41.79 
 
 
108 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000544894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1394  translation initiation factor Sui1  41.79 
 
 
108 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000598621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1485  translation initiation factor Sui1  41.79 
 
 
108 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305323  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2344  translation initiation factor Sui1  41.79 
 
 
108 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000454927  unclonable  0.000000015805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4599  translation initiation factor Sui1  38.81 
 
 
123 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1338  translation initiation factor Sui1  35.82 
 
 
109 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0446445  hitchhiker  0.000386966 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1917  translation initiation factor Sui1  41.79 
 
 
109 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000003145  hitchhiker  0.00000000000000420932 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1133  translation initiation factor Sui1  37.31 
 
 
109 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129077  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0611  translation initiation factor Sui1  38.81 
 
 
123 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0649934 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1511  translation initiation factor Sui1  41.79 
 
 
108 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000972273  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0636  translation initiation factor Sui1  43.28 
 
 
103 aa  47  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171454  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1846  translation initiation factor Sui1  41.79 
 
 
109 aa  47  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000134227  hitchhiker  8.5212e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>