139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2911 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2911  translation initiation factor Sui1  100 
 
 		 101 aa  205  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1902  translation initiation factor Sui1  89.11 
 
 		 101 aa  183  6e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1997  translation initiation factor Sui1  84.16 
 
 		 101 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1990  translation initiation factor Sui1  81.19 
 
 		 101 aa  174  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0321  translation initiation factor Sui1  78.22 
 
 		 101 aa  167  5e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0534  translation initiation factor Sui1  67 
 
 		 102 aa  152  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0366  translation initiation factor Sui1  68.32 
 
 		 102 aa  148  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.485747  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2049  translation initiation factor Sui1  64 
 
 		 102 aa  143  6e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  9.06796e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0627  translation initiation factor Sui1  62.37 
 
 		 97 aa  133  9e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.344568  normal  0.0369514 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2534  translation initiation factor Sui1  62.37 
 
 		 97 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3580  translation initiation factor SUI1  58.06 
 
 		 97 aa  128  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1589  translation initiation factor SUI1  58.06 
 
 		 97 aa  127  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2078  translation initiation factor Sui1  62.37 
 
 		 97 aa  120  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.157753  normal  0.161852 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0717  translation initiation factor Sui1  56.25 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00154405  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1391  translation initiation factor Sui1  56.25 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0172  translation initiation factor Sui1  56.25 
 
 		 102 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0000141332  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0651  translation initiation factor Sui1  56.25 
 
 		 102 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000000000433453  decreased coverage  0.0000613351 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1267  translation initiation factor Sui1  56.25 
 
 		 102 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000000776224  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0210  translation initiation factor SUI1  52.69 
 
 		 98 aa  108  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0622  translation initiation factor SUI1  47.92 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2210  translation initiation factor Sui1  56.04 
 
 		 99 aa  95.1  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000269686 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1423  translation initiation factor SUI1  51.65 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0505  translation initiation factor SUI1  45.24 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.583781  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2075  translation initiation factor SUI1  46.58 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0760  translation initiation factor SUI1  44.9 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3637  translation initiation factor SUI1  43.84 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3154  translation initiation factor Sui1  41.98 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2964  translation initiation factor Sui1  41.98 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3941  translation initiation factor SUI1  40.26 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3853  translation initiation factor SUI1  37.36 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1504  translation initiation factor SUI1  44.78 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2865  translation initiation factor SUI1  36.36 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2838  translation initiation factor SUI1  34.83 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.179746  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2806  translation initiation factor Sui1  35 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1754  translation initiation factor SUI1  30.3 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000000113267  hitchhiker  0.00210388 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3549  translation initiation factor SUI1  34.65 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0680444 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1443  translation initiation factor SUI1  38.1 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00199904  normal  0.134693 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0438  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  31.31 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0413  translation initiation factor Sui1  39.8 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1910  translation initiation factor Sui1  40.26 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2854  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  41.25 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339586  normal  0.0877983 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0691  translation initiation factor Sui1  34 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402227  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2419  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  40.51 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4810  translation initiation factor Sui1  38.96 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5669  translation initiation factor SUI1  36.36 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1480  translation initiation factor Sui1  34.65 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0343  translation initiation factor Sui1  36.36 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000865275  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0471  translation initiation factor SUI1  37.35 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3188  translation initiation factor SUI1  34.57 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00588203  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0267  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  33.01 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0972  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  46.77 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017895  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3343  translation initiation factor Sui1  40.28 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0413  translation initiation factor Sui1  38.78 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0584  translation initiation factor SUI1  28.28 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00019387 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1574  translation initiation factor SUI1  29.29 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1912  translation initiation factor Sui1  46.77 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000470884  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2237  translation initiation factor Sui1  46.77 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0294222  normal  0.0125302 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2023  translation initiation factor Sui1  46.77 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.785803  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4092  translation initiation factor SUI1  39.24 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2364  translation initiation factor Sui1  48.39 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0271288  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0321  translation initiation factor SUI1  37.62 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2734  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  34.62 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2580  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  41.54 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0563  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  43.08 
 
 		 83 aa  52.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5560  translation initiation factor Sui1  34.41 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0248  translation initation factor SUI1, putative  35.37 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0636  translation initiation factor Sui1  41.54 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171454  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2059  translation initiation factor SUI1  34.02 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2203  translation initiation factor SUI1  32.99 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.513989 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64000  translation initiation factor Sui1  33.33 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2639  translation initiation factor Sui1  46.77 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000116235  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4188  translation initiation factor SUI1  40 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1757  translation initiation factor SUI1  38 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0909  translation initiation factor SUI1  41.94 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000312588  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2186  translation initiation factor Sui1  45.16 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.019439  hitchhiker  0.000338309 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0917  translation initiation factor SUI1  41.94 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00387468  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4841  translation initiation factor SUI1, putative  33.33 
 
 		 123 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1704  translation initiation factor SUI1  46.77 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00246322  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3595  translation initiation factor SUI1  38.03 
 
 		 112 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52235  normal  0.025407 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1737  translation initiation factor SUI1  45.16 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084137  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01715  Sui1 family protein  44.62 
 
 		 110 aa  50.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10953  putative translation initiation factor  37.14 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.788012  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2646  translation initiation factor Sui1  45.16 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000146872  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1627  translation initiation factor SUI1  33.33 
 
 		 113 aa  50.4  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2195  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  32 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0976146  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0905  translation initiation factor SUI1  43.55 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.348885  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27071  translation initiation factor SUI1  37.5 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1917  translation initiation factor Sui1  45.16 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000003145  hitchhiker  0.00000000000000420932 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1511  translation initiation factor Sui1  45.16 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000972273  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01259  translation initiation factor Sui1  45.16 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000686676  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2365  translation initiation factor SUI1  45.16 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110904  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000152  translation initiation factor SUI1-related protein  43.08 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01270  hypothetical protein  45.16 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000544894  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1625  translation initiation factor Sui1  43.55 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00194965  hitchhiker  4.78145e-19 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0726  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  29.47 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2344  translation initiation factor Sui1  45.16 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000454927  unclonable  0.000000015805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1846  translation initiation factor Sui1  45.16 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000134227  hitchhiker  8.5212e-20 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1830  translation initiation factor Sui1  43.55 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0277649  hitchhiker  8.595610000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1892  translation initiation factor Sui1  43.55 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000000000000626787 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1835  translation initiation factor Sui1  43.55 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00136333  hitchhiker  0.000244384 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>