140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1737 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1737  translation initiation factor SUI1  100 
 
 		 108 aa  209  7e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084137  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01259  translation initiation factor Sui1  86.11 
 
 		 108 aa  183  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000686676  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2365  translation initiation factor SUI1  86.11 
 
 		 108 aa  183  7e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110904  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01270  hypothetical protein  86.11 
 
 		 108 aa  183  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000544894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1394  translation initiation factor Sui1  86.11 
 
 		 108 aa  183  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000598621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1485  translation initiation factor Sui1  86.11 
 
 		 108 aa  183  7e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305323  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2344  translation initiation factor Sui1  86.11 
 
 		 108 aa  183  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000454927  unclonable  0.000000015805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1846  translation initiation factor Sui1  85.19 
 
 		 109 aa  183  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000134227  hitchhiker  8.5212e-20 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1511  translation initiation factor Sui1  85.19 
 
 		 108 aa  182  9e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000972273  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1704  translation initiation factor SUI1  86.11 
 
 		 108 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00246322  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1917  translation initiation factor Sui1  84.26 
 
 		 109 aa  180  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000003145  hitchhiker  0.00000000000000420932 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2646  translation initiation factor Sui1  85.19 
 
 		 108 aa  177  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000146872  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2186  translation initiation factor Sui1  81.48 
 
 		 108 aa  176  9e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.019439  hitchhiker  0.000338309 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2364  translation initiation factor Sui1  82.24 
 
 		 111 aa  176  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0271288  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1625  translation initiation factor Sui1  78.7 
 
 		 108 aa  175  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00194965  hitchhiker  4.78145e-19 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1443  translation initiation factor Sui1  78.7 
 
 		 108 aa  175  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1830  translation initiation factor Sui1  78.7 
 
 		 108 aa  175  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0277649  hitchhiker  8.595610000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1892  translation initiation factor Sui1  78.7 
 
 		 108 aa  175  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000000000000626787 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1835  translation initiation factor Sui1  78.7 
 
 		 108 aa  175  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00136333  hitchhiker  0.000244384 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2639  translation initiation factor Sui1  82.24 
 
 		 109 aa  174  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000116235  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1912  translation initiation factor Sui1  79.63 
 
 		 108 aa  170  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000470884  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2237  translation initiation factor Sui1  79.63 
 
 		 108 aa  170  5e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0294222  normal  0.0125302 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2023  translation initiation factor Sui1  79.63 
 
 		 108 aa  170  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.785803  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000152  translation initiation factor SUI1-related protein  74.26 
 
 		 103 aa  148  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05783  translation initiation factor Sui1  73.27 
 
 		 103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0972  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  63.11 
 
 		 105 aa  135  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017895  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0636  translation initiation factor Sui1  63.37 
 
 		 103 aa  130  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171454  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2471  translation initiation factor Sui1  59.43 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.827071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3018  translation initiation factor Sui1  59.81 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000751139  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3033  translation initiation factor Sui1  59.81 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000199492  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1345  translation initiation factor Sui1  59.81 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00294429  hitchhiker  0.000000000546863 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3345  translation initiation factor Sui1  58.49 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1201  translation initiation factor Sui1  58.49 
 
 		 109 aa  121  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0177618  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3176  translation initiation factor Sui1  58.88 
 
 		 112 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00012053  hitchhiker  0.0057416 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2680  translation initiation factor Sui1  58.1 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1271  translation initiation factor Sui1  57.55 
 
 		 109 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000428708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2851  translation initiation factor Sui1  54.72 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181646  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1592  translation initiation factor SUI1  56.48 
 
 		 106 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01715  Sui1 family protein  61.32 
 
 		 110 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1200  translation initiation factor Sui1  56.6 
 
 		 109 aa  117  7e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000764802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1145  translation initiation factor Sui1  56.6 
 
 		 109 aa  117  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.244875  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1163  translation initiation factor SUI1  59 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0953729  normal  0.11202 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2580  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  54.29 
 
 		 107 aa  115  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1238  translation initiation factor Sui1  53.27 
 
 		 109 aa  114  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.120876 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0513  translation initiation factor Sui1  75.25 
 
 		 126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.435578  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2675  translation initiation factor Sui1  55.66 
 
 		 121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000045449  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2865  translation initiation factor SUI1  56.36 
 
 		 119 aa  110  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1338  translation initiation factor Sui1  54.13 
 
 		 109 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0446445  hitchhiker  0.000386966 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1133  translation initiation factor Sui1  52.83 
 
 		 109 aa  107  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129077  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1443  translation initiation factor SUI1  52.07 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00199904  normal  0.134693 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1480  translation initiation factor Sui1  51.28 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0343  translation initiation factor Sui1  51.28 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000865275  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0267  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  50.41 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0691  translation initiation factor Sui1  48.28 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402227  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1185  translation initiation factor SUI1  49.56 
 
 		 114 aa  99.8  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00309802  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0413  translation initiation factor Sui1  48.28 
 
 		 122 aa  97.8  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3689  putative translation initation factor SUI1  52.78 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0413  translation initiation factor Sui1  46.55 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0726  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  50 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0626  translation initiation factor Sui1  49.09 
 
 		 123 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3549  translation initiation factor SUI1  43.59 
 
 		 120 aa  89.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0680444 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2059  translation initiation factor SUI1  45.22 
 
 		 120 aa  88.2  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0605  translation initiation factor SUI1  48.18 
 
 		 184 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2203  translation initiation factor SUI1  45.54 
 
 		 114 aa  87.8  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.513989 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2806  translation initiation factor Sui1  45.69 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4599  translation initiation factor Sui1  47.27 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0566  translation initiation factor Sui1  48.18 
 
 		 123 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0611  translation initiation factor Sui1  48.18 
 
 		 123 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649934 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2195  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  46.43 
 
 		 121 aa  86.7  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0976146  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1568  translation initiation factor Sui1  44.07 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4380  translation initiation factor Sui1  47.27 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5560  translation initiation factor Sui1  47.27 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4512  translation initiation factor SUI1  48.11 
 
 		 112 aa  84.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.477068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4841  translation initiation factor SUI1, putative  46.36 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64000  translation initiation factor Sui1  46.36 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1627  translation initiation factor SUI1  41.59 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0563  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  52.44 
 
 		 83 aa  83.2  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5669  translation initiation factor SUI1  42.86 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07040  translation initiation factor Sui1  44.55 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3853  translation initiation factor SUI1  40.91 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1757  translation initiation factor SUI1  42.74 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0321  translation initiation factor SUI1  46.61 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2734  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  39.13 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3154  translation initiation factor Sui1  47.37 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2964  translation initiation factor Sui1  47.37 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4810  translation initiation factor Sui1  47.37 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3343  translation initiation factor Sui1  38.1 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4092  translation initiation factor SUI1  40.54 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4188  translation initiation factor SUI1  39.09 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2099  putative translation initiation factor SUI1  43.53 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2142  translation initiation factor Sui1  39.62 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.183879  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3188  translation initiation factor SUI1  42.68 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00588203  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2419  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  41.05 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1910  translation initiation factor Sui1  43.42 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1532  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  37.5 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02391  translation initiation factor SUI1  37.5 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27071  translation initiation factor SUI1  35.35 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2075  translation initiation factor SUI1  41.18 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0471  translation initiation factor SUI1  36.79 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1504  translation initiation factor SUI1  50.75 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>