135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0627 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0627  translation initiation factor Sui1  100 
 
 		 97 aa  197  5e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.344568  normal  0.0369514 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2534  translation initiation factor Sui1  98.97 
 
 		 97 aa  196  1.0000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1589  translation initiation factor SUI1  89.69 
 
 		 97 aa  184  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3580  translation initiation factor SUI1  88.66 
 
 		 97 aa  181  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2078  translation initiation factor Sui1  91.75 
 
 		 97 aa  166  7e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.157753  normal  0.161852 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0366  translation initiation factor Sui1  61.46 
 
 		 102 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.485747  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1997  translation initiation factor Sui1  63.44 
 
 		 101 aa  135  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2911  translation initiation factor Sui1  62.37 
 
 		 101 aa  133  9e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0534  translation initiation factor Sui1  58.51 
 
 		 102 aa  130  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1902  translation initiation factor Sui1  59.78 
 
 		 101 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2049  translation initiation factor Sui1  58.51 
 
 		 102 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  9.06796e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1990  translation initiation factor Sui1  59.14 
 
 		 101 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0321  translation initiation factor Sui1  52.63 
 
 		 101 aa  120  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1391  translation initiation factor Sui1  51.58 
 
 		 113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0622  translation initiation factor SUI1  48.94 
 
 		 102 aa  105  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0210  translation initiation factor SUI1  52.81 
 
 		 98 aa  103  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0717  translation initiation factor Sui1  47.37 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00154405  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0172  translation initiation factor Sui1  47.37 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0000141332  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0651  translation initiation factor Sui1  47.37 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000000000433453  decreased coverage  0.0000613351 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1267  translation initiation factor Sui1  47.37 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000000776224  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2075  translation initiation factor SUI1  56.41 
 
 		 98 aa  95.5  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2210  translation initiation factor Sui1  53.49 
 
 		 99 aa  90.1  8e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000269686 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1423  translation initiation factor SUI1  48.84 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3637  translation initiation factor SUI1  52.56 
 
 		 98 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0505  translation initiation factor SUI1  44.3 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.583781  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0760  translation initiation factor SUI1  40.96 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0471  translation initiation factor SUI1  34.88 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3941  translation initiation factor SUI1  33.75 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3853  translation initiation factor SUI1  33.33 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2838  translation initiation factor SUI1  37.21 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.179746  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1912  translation initiation factor Sui1  46.77 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000470884  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2237  translation initiation factor Sui1  46.77 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0294222  normal  0.0125302 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2023  translation initiation factor Sui1  46.77 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.785803  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2364  translation initiation factor Sui1  46.77 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0271288  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2806  translation initiation factor Sui1  34.69 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1480  translation initiation factor Sui1  33.33 
 
 		 120 aa  57  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1627  translation initiation factor SUI1  32.63 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1504  translation initiation factor SUI1  32.98 
 
 		 107 aa  57  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0413  translation initiation factor Sui1  37.93 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10953  putative translation initiation factor  42.19 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.788012  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1757  translation initiation factor SUI1  34.69 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2854  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  32.5 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339586  normal  0.0877983 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0438  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  35.87 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1754  translation initiation factor SUI1  31.87 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000000113267  hitchhiker  0.00210388 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5669  translation initiation factor SUI1  33.33 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0413  translation initiation factor Sui1  33.66 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0248  translation initation factor SUI1, putative  37.8 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2203  translation initiation factor SUI1  31.91 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.513989 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0691  translation initiation factor Sui1  33.67 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402227  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1704  translation initiation factor SUI1  43.55 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00246322  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01715  Sui1 family protein  47.62 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2639  translation initiation factor Sui1  37.08 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000116235  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3549  translation initiation factor SUI1  31.63 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0680444 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2865  translation initiation factor SUI1  29.59 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0584  translation initiation factor SUI1  32.22 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00019387 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1443  translation initiation factor SUI1  33.33 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00199904  normal  0.134693 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2186  translation initiation factor Sui1  41.94 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.019439  hitchhiker  0.000338309 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0267  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  30.69 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0343  translation initiation factor Sui1  30 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000865275  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1574  translation initiation factor SUI1  31.87 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0636  translation initiation factor Sui1  41.94 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171454  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01259  translation initiation factor Sui1  41.94 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000686676  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2365  translation initiation factor SUI1  41.94 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110904  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1394  translation initiation factor Sui1  41.94 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000598621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1485  translation initiation factor Sui1  41.94 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305323  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01270  hypothetical protein  41.94 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000544894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4810  translation initiation factor Sui1  36 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2344  translation initiation factor Sui1  41.94 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000454927  unclonable  0.000000015805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1846  translation initiation factor Sui1  41.94 
 
 		 109 aa  52  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000134227  hitchhiker  8.5212e-20 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1511  translation initiation factor Sui1  41.94 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000972273  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1917  translation initiation factor Sui1  41.94 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000003145  hitchhiker  0.00000000000000420932 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2580  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  35.48 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2734  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  31.37 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3343  translation initiation factor Sui1  27.66 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1737  translation initiation factor SUI1  40.32 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084137  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2059  translation initiation factor SUI1  31.25 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05783  translation initiation factor Sui1  35.96 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2964  translation initiation factor Sui1  37.33 
 
 		 117 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0972  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  37.1 
 
 		 105 aa  51.2  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017895  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64000  translation initiation factor Sui1  30.53 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2646  translation initiation factor Sui1  40.32 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000146872  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3154  translation initiation factor Sui1  37.33 
 
 		 117 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000152  translation initiation factor SUI1-related protein  34.83 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1830  translation initiation factor Sui1  38.71 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0277649  hitchhiker  8.595610000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1892  translation initiation factor Sui1  38.71 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000000000000626787 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1835  translation initiation factor Sui1  38.71 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00136333  hitchhiker  0.000244384 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1443  translation initiation factor Sui1  38.71 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1625  translation initiation factor Sui1  38.71 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00194965  hitchhiker  4.78145e-19 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3188  translation initiation factor SUI1  30.12 
 
 		 118 aa  50.8  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00588203  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5560  translation initiation factor Sui1  33.68 
 
 		 123 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0024  translation initiation factor SUI1  27.72 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.178151  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4092  translation initiation factor SUI1  34.18 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0563  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  40.32 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07040  translation initiation factor Sui1  31.58 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1910  translation initiation factor Sui1  34.21 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27071  translation initiation factor SUI1  34.57 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0611  translation initiation factor Sui1  31.58 
 
 		 123 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649934 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2419  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  32.1 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2195  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  35.48 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0976146  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1568  translation initiation factor Sui1  38.71 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>