More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0048 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1143  aspartate aminotransferase  98.56 
 
 
416 aa  842    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1494  aspartate aminotransferase  76.68 
 
 
416 aa  679    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0775  aspartate aminotransferase  98.32 
 
 
416 aa  842    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.262362  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0048  aspartate aminotransferase  100 
 
 
416 aa  853    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0840  aspartate aminotransferase  89.18 
 
 
416 aa  753    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.617239  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0546  aspartate aminotransferase  62.98 
 
 
411 aa  521  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.461128  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  40.93 
 
 
384 aa  261  1e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  40.69 
 
 
385 aa  260  3e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  39.51 
 
 
388 aa  256  6e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.99 
 
 
391 aa  249  7e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  38.25 
 
 
382 aa  247  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  41.21 
 
 
382 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  41.84 
 
 
382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  40.91 
 
 
390 aa  243  5e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  41.21 
 
 
386 aa  243  6e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.01 
 
 
388 aa  242  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  40.52 
 
 
382 aa  241  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.77 
 
 
388 aa  239  5e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.8 
 
 
385 aa  238  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.24 
 
 
389 aa  237  3e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.64 
 
 
389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  38.99 
 
 
384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  40.99 
 
 
390 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.88 
 
 
387 aa  229  6e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  36.93 
 
 
388 aa  229  7e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  35.34 
 
 
389 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  40.3 
 
 
392 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.12 
 
 
391 aa  226  5.0000000000000005e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.29 
 
 
392 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.17 
 
 
388 aa  224  2e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  33.96 
 
 
403 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  39.53 
 
 
394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  36.91 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.14 
 
 
388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  33.96 
 
 
402 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  38 
 
 
399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  37.43 
 
 
395 aa  217  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  36 
 
 
392 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  38.54 
 
 
399 aa  216  7e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  37.67 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  35.29 
 
 
391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2650  aspartate aminotransferase  37.87 
 
 
400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.036454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  37.87 
 
 
399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2938  aspartate aminotransferase  37.54 
 
 
399 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063979  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  34.7 
 
 
401 aa  213  7e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  35.26 
 
 
390 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  34.24 
 
 
396 aa  211  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2700  aspartate aminotransferase  36.88 
 
 
400 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.546945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2899  aspartate aminotransferase  36.88 
 
 
399 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2901  aspartate aminotransferase  37.21 
 
 
399 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246294 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2948  aspartate aminotransferase  37.46 
 
 
399 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00498644  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1447  aminotransferase class I and II  35.42 
 
 
398 aa  210  4e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000395976  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  32.33 
 
 
394 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  36.54 
 
 
400 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  32.33 
 
 
394 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  31.65 
 
 
392 aa  206  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  31.38 
 
 
392 aa  206  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  33.13 
 
 
392 aa  206  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  35.95 
 
 
387 aa  206  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  32.47 
 
 
391 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  32.83 
 
 
392 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  32.08 
 
 
400 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  32.83 
 
 
392 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  32.83 
 
 
392 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  32.83 
 
 
392 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1544  aminotransferase  34.25 
 
 
405 aa  203  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553471  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  30.93 
 
 
392 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1454  aminotransferase  34.25 
 
 
405 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  hitchhiker  0.000434542 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0165  aspartate aminotransferase  32.32 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  33.62 
 
 
392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1923  aminotransferase  33.97 
 
 
405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351936  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  34.35 
 
 
392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  32.22 
 
 
406 aa  200  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  31.91 
 
 
392 aa  201  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2278  aminotransferase  33.15 
 
 
405 aa  200  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874685  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0292  aspartate aminotransferase  32.52 
 
 
402 aa  199  5e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1299  aminotransferase  31.88 
 
 
403 aa  199  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1738  aminotransferase  34.52 
 
 
405 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.990718  normal  0.152146 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0186  aspartate aminotransferase  32.06 
 
 
400 aa  199  7.999999999999999e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  33.52 
 
 
393 aa  199  9e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  33.52 
 
 
393 aa  199  9e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  33.97 
 
 
389 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0567  aminotransferase class I and II  34.93 
 
 
403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0018  transaminase  33.69 
 
 
394 aa  198  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  33.13 
 
 
395 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0146  aspartate aminotransferase  31.55 
 
 
400 aa  197  3e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.126801  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0168  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 
403 aa  197  3e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.391722  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0506  aminotransferase  34.01 
 
 
406 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0194715  normal  0.65304 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  32.83 
 
 
390 aa  196  7e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0499  transaminase  34.57 
 
 
393 aa  196  8.000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000751793  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  31.51 
 
 
411 aa  196  9e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  32.03 
 
 
412 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  31.77 
 
 
412 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  32.03 
 
 
412 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1145  aspartate aminotransferase  31.85 
 
 
402 aa  195  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  32.03 
 
 
412 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  32.03 
 
 
412 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  32.03 
 
 
412 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2505  aminotransferase  33.13 
 
 
407 aa  195  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784571  normal  0.124527 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1415  aspartate aminotransferase  32.32 
 
 
400 aa  194  2e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>