30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2383 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2383  type II secretion system protein N  100 
 
 		 262 aa  499  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000842223 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2386  type II secretion system protein N  35.55 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4724  type II secretion system protein N  24.42 
 
 		 252 aa  92  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3609  type II secretion system protein N  27.38 
 
 		 253 aa  89  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0161  type II secretion system protein N  24.11 
 
 		 253 aa  85.9  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0161  type II secretion system protein N  24.11 
 
 		 253 aa  85.9  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0166  type II secretion system protein N  24.11 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0238  type II secretion system protein N  31.43 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0164  type II secretion system protein N  24.6 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0159  type II secretion system protein N  24.6 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0163  type II secretion system protein N  24.6 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.105061 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0115  type II secretion system protein N  25.9 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4196  type II secretion system protein N  24.21 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.876892  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0176  general secretion pathway protein N  23.72 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4348  type II secretion system protein N  24.9 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.507417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3557  type II secretion system protein N  23.41 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0241  type II secretion system protein N  25.9 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335063  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0154  type II secretion system protein N  23.05 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0265405  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2850  type II secretion system protein N  25.6 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0107  type II secretion system protein N  25.38 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.692762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2296  general secretion pathway protein N  27.23 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0131  type II secretion system protein N  19.92 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00611  general secretion pathway protein N  24.88 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001882  general secretion pathway protein N  25 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1575  type II secretion system protein N  28.24 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.524365  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4581  general secretion pathway protein N  23.6 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2914  general secretion pathway protein N  19.91 
 
 		 253 aa  52.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3570  hypothetical protein  24.5 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.453301 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0179  general secretion pathway protein N  22.75 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03966  putative general secretion pathway protein N  23.94 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>