41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0131 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0131  type II secretion system protein N  100 
 
 		 253 aa  510  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0115  type II secretion system protein N  57.71 
 
 		 253 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4196  type II secretion system protein N  58.1 
 
 		 253 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.876892  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0159  type II secretion system protein N  57.71 
 
 		 253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0163  type II secretion system protein N  57.71 
 
 		 253 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.105061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0166  type II secretion system protein N  57.71 
 
 		 253 aa  305  6e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0164  type II secretion system protein N  57.71 
 
 		 253 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0161  type II secretion system protein N  57.31 
 
 		 253 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0161  type II secretion system protein N  57.31 
 
 		 253 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3557  type II secretion system protein N  56.52 
 
 		 253 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0176  general secretion pathway protein N  54.55 
 
 		 253 aa  296  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4348  type II secretion system protein N  52.99 
 
 		 252 aa  295  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.507417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3609  type II secretion system protein N  50.99 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4724  type II secretion system protein N  52.19 
 
 		 252 aa  280  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0154  type II secretion system protein N  48.61 
 
 		 252 aa  270  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0265405  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0179  general secretion pathway protein N  44.58 
 
 		 251 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0241  type II secretion system protein N  28.86 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335063  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0107  type II secretion system protein N  29.84 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.692762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2296  general secretion pathway protein N  28.69 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001882  general secretion pathway protein N  27.38 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00611  general secretion pathway protein N  25.4 
 
 		 253 aa  99.8  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03966  putative general secretion pathway protein N  28.86 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2914  general secretion pathway protein N  25.4 
 
 		 253 aa  98.6  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4581  general secretion pathway protein N  22.92 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2850  type II secretion system protein N  22.13 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2383  type II secretion system protein N  19.92 
 
 		 262 aa  62  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000842223 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3570  hypothetical protein  24.39 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.453301 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2386  type II secretion system protein N  26.51 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0918  type II secretion system protein N  29 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.339079  normal  0.312737 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3081  type II secretion system protein N  22.93 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173881  hitchhiker  0.000000265494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4171  type II secretion system protein N  34.44 
 
 		 219 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.245137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1052  type II secretion system protein N  37.18 
 
 		 219 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.116969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1096  hypothetical protein  29.79 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647974  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0238  type II secretion system protein N  23.48 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3507  general secretory pathway protein N  23.79 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1879  general secretory pathway protein N  23.79 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.174297  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2774  general secretory pathway protein N  23.79 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2673  general secretory pathway protein N  23.79 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333526  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0019  general secretory pathway protein N  23.79 
 
 		 263 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0275939  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0231  general secretory pathway protein N  23.79 
 
 		 263 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0019  general secretory pathway protein N  23.79 
 
 		 263 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.470521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>