30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0241 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0241  type II secretion system protein N  100 
 
 		 247 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335063  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03966  putative general secretion pathway protein N  43.5 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4348  type II secretion system protein N  33.74 
 
 		 252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.507417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3609  type II secretion system protein N  33.73 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0131  type II secretion system protein N  28.86 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4724  type II secretion system protein N  29.67 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4581  general secretion pathway protein N  30.67 
 
 		 251 aa  125  8.000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0115  type II secretion system protein N  28.92 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0154  type II secretion system protein N  29.37 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0265405  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0163  type II secretion system protein N  27.64 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.105061 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0159  type II secretion system protein N  27.64 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0164  type II secretion system protein N  27.24 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4196  type II secretion system protein N  27.24 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.876892  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0161  type II secretion system protein N  26.42 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0161  type II secretion system protein N  26.42 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0166  type II secretion system protein N  26.42 
 
 		 253 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0176  general secretion pathway protein N  25.61 
 
 		 253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3557  type II secretion system protein N  26.83 
 
 		 253 aa  112  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0179  general secretion pathway protein N  28.28 
 
 		 251 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2296  general secretion pathway protein N  26.4 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001882  general secretion pathway protein N  25.79 
 
 		 253 aa  92.8  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0107  type II secretion system protein N  27.94 
 
 		 250 aa  90.5  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.692762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00611  general secretion pathway protein N  24.9 
 
 		 253 aa  87.8  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2914  general secretion pathway protein N  25.4 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2383  type II secretion system protein N  25.9 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000842223 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3570  hypothetical protein  27.71 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.453301 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0238  type II secretion system protein N  26.34 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2850  type II secretion system protein N  23.05 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2386  type II secretion system protein N  23.35 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3391  type II secretion system protein N  31.11 
 
 		 268 aa  49.3  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>