26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2914 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2914  general secretion pathway protein N  100 
 
 		 253 aa  517  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001882  general secretion pathway protein N  46.25 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00611  general secretion pathway protein N  44.66 
 
 		 253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2296  general secretion pathway protein N  41.9 
 
 		 252 aa  221  9e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0107  type II secretion system protein N  29.53 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.692762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0154  type II secretion system protein N  27.67 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0265405  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4348  type II secretion system protein N  27.17 
 
 		 252 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.507417 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4724  type II secretion system protein N  28.06 
 
 		 252 aa  105  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0115  type II secretion system protein N  23.39 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0131  type II secretion system protein N  25.4 
 
 		 253 aa  98.6  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3609  type II secretion system protein N  26.48 
 
 		 253 aa  92.8  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0164  type II secretion system protein N  24.48 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0161  type II secretion system protein N  21.6 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0161  type II secretion system protein N  21.6 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0159  type II secretion system protein N  24.07 
 
 		 253 aa  89  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0163  type II secretion system protein N  24.07 
 
 		 253 aa  89  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.105061 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4196  type II secretion system protein N  23.65 
 
 		 253 aa  88.6  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.876892  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0166  type II secretion system protein N  21.6 
 
 		 253 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4581  general secretion pathway protein N  27.13 
 
 		 251 aa  87.8  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0176  general secretion pathway protein N  20.8 
 
 		 253 aa  85.5  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0179  general secretion pathway protein N  23.62 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0241  type II secretion system protein N  25.4 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335063  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3557  type II secretion system protein N  22.45 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03966  putative general secretion pathway protein N  23.95 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2850  type II secretion system protein N  20.78 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2383  type II secretion system protein N  19.91 
 
 		 262 aa  52.8  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000842223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>