27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2850 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2850  type II secretion system protein N  100 
 
 		 248 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00611  general secretion pathway protein N  26.4 
 
 		 253 aa  99.4  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0107  type II secretion system protein N  29.48 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.692762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001882  general secretion pathway protein N  25.2 
 
 		 253 aa  96.3  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2296  general secretion pathway protein N  24.21 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4348  type II secretion system protein N  25 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.507417 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0179  general secretion pathway protein N  26.14 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2914  general secretion pathway protein N  20.78 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4581  general secretion pathway protein N  24.69 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0115  type II secretion system protein N  24.6 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0241  type II secretion system protein N  23.05 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335063  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2383  type II secretion system protein N  25.6 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000842223 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4724  type II secretion system protein N  23.62 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0131  type II secretion system protein N  22.13 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3609  type II secretion system protein N  23.75 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0154  type II secretion system protein N  21.74 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0265405  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0176  general secretion pathway protein N  21.49 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0163  type II secretion system protein N  20.75 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.105061 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4196  type II secretion system protein N  20.75 
 
 		 253 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.876892  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0159  type II secretion system protein N  20.33 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0161  type II secretion system protein N  20.33 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0161  type II secretion system protein N  20.33 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0166  type II secretion system protein N  20.33 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0164  type II secretion system protein N  19.5 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3557  type II secretion system protein N  20.33 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03966  putative general secretion pathway protein N  22.13 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2386  type II secretion system protein N  23.32 
 
 		 277 aa  42  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>