28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3609 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3609  type II secretion system protein N  100 
 
 		 253 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4348  type II secretion system protein N  64.14 
 
 		 252 aa  363  1e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.507417 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4724  type II secretion system protein N  65.74 
 
 		 252 aa  361  6e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0154  type II secretion system protein N  58.96 
 
 		 252 aa  333  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0265405  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0161  type II secretion system protein N  59.68 
 
 		 253 aa  330  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0161  type II secretion system protein N  59.68 
 
 		 253 aa  330  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0166  type II secretion system protein N  59.68 
 
 		 253 aa  328  4e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0176  general secretion pathway protein N  58.1 
 
 		 253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0163  type II secretion system protein N  57.31 
 
 		 253 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.105061 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0159  type II secretion system protein N  57.31 
 
 		 253 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4196  type II secretion system protein N  56.92 
 
 		 253 aa  322  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.876892  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3557  type II secretion system protein N  55.73 
 
 		 253 aa  322  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0164  type II secretion system protein N  57.31 
 
 		 253 aa  322  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0115  type II secretion system protein N  56.92 
 
 		 253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0131  type II secretion system protein N  50.99 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0179  general secretion pathway protein N  46.83 
 
 		 251 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0241  type II secretion system protein N  33.73 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335063  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0107  type II secretion system protein N  29.44 
 
 		 250 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.692762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001882  general secretion pathway protein N  30.04 
 
 		 253 aa  108  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2296  general secretion pathway protein N  28.33 
 
 		 252 aa  99  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00611  general secretion pathway protein N  26.98 
 
 		 253 aa  98.6  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03966  putative general secretion pathway protein N  28.05 
 
 		 254 aa  97.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2914  general secretion pathway protein N  26.48 
 
 		 253 aa  92.8  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2383  type II secretion system protein N  27.38 
 
 		 262 aa  89  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000842223 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4581  general secretion pathway protein N  27.2 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2850  type II secretion system protein N  23.75 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2386  type II secretion system protein N  25.1 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0238  type II secretion system protein N  24.14 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>