30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0163 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0163  type II secretion system protein N  100 
 
 		 253 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.105061 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0164  type II secretion system protein N  98.81 
 
 		 253 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0159  type II secretion system protein N  99.6 
 
 		 253 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4196  type II secretion system protein N  99.21 
 
 		 253 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.876892  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0161  type II secretion system protein N  88.93 
 
 		 253 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0161  type II secretion system protein N  88.93 
 
 		 253 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0166  type II secretion system protein N  88.14 
 
 		 253 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3557  type II secretion system protein N  89.33 
 
 		 253 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0176  general secretion pathway protein N  86.17 
 
 		 253 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4348  type II secretion system protein N  63.75 
 
 		 252 aa  345  6e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.507417 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4724  type II secretion system protein N  63.35 
 
 		 252 aa  337  9e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0115  type II secretion system protein N  60.08 
 
 		 253 aa  331  6e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3609  type II secretion system protein N  57.31 
 
 		 253 aa  323  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0154  type II secretion system protein N  56.97 
 
 		 252 aa  317  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0265405  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0131  type II secretion system protein N  57.71 
 
 		 253 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0179  general secretion pathway protein N  45.82 
 
 		 251 aa  259  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0241  type II secretion system protein N  27.64 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335063  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0107  type II secretion system protein N  27.42 
 
 		 250 aa  115  7.999999999999999e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.692762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001882  general secretion pathway protein N  26.77 
 
 		 253 aa  99  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2296  general secretion pathway protein N  26 
 
 		 252 aa  96.3  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00611  general secretion pathway protein N  23.72 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2914  general secretion pathway protein N  24.07 
 
 		 253 aa  89  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03966  putative general secretion pathway protein N  27.24 
 
 		 254 aa  85.1  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2383  type II secretion system protein N  24.6 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000842223 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2850  type II secretion system protein N  20.75 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4581  general secretion pathway protein N  27.92 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2386  type II secretion system protein N  25 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3570  hypothetical protein  25.4 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.453301 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0238  type II secretion system protein N  24 
 
 		 261 aa  42.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0325  type II secretion system protein N  25.1 
 
 		 238 aa  42.7  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>