29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2296 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2296  general secretion pathway protein N  100 
 
 		 252 aa  503  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00611  general secretion pathway protein N  45.06 
 
 		 253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001882  general secretion pathway protein N  45.85 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2914  general secretion pathway protein N  41.9 
 
 		 253 aa  221  9e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0107  type II secretion system protein N  28.11 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.692762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0154  type II secretion system protein N  27.78 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0265405  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0115  type II secretion system protein N  31.45 
 
 		 253 aa  115  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0131  type II secretion system protein N  28.69 
 
 		 253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0179  general secretion pathway protein N  29.64 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4348  type II secretion system protein N  26.98 
 
 		 252 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.507417 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4724  type II secretion system protein N  26.64 
 
 		 252 aa  106  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0241  type II secretion system protein N  26.4 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335063  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3609  type II secretion system protein N  28.33 
 
 		 253 aa  99  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0163  type II secretion system protein N  26 
 
 		 253 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.105061 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3557  type II secretion system protein N  26.4 
 
 		 253 aa  95.9  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0159  type II secretion system protein N  26 
 
 		 253 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4196  type II secretion system protein N  25.6 
 
 		 253 aa  95.5  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.876892  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0164  type II secretion system protein N  26 
 
 		 253 aa  95.1  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4581  general secretion pathway protein N  25.98 
 
 		 251 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2850  type II secretion system protein N  24.21 
 
 		 248 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0176  general secretion pathway protein N  25.94 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0161  type II secretion system protein N  25.1 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0161  type II secretion system protein N  25.1 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0166  type II secretion system protein N  25.1 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03966  putative general secretion pathway protein N  23.85 
 
 		 254 aa  85.1  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2383  type II secretion system protein N  27.23 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000842223 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0260  type II secretion system protein N  34.44 
 
 		 254 aa  52.4  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0543  hypothetical protein  23.87 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0238  type II secretion system protein N  27.47 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>