30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0238 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0238  type II secretion system protein N  100 
 
 		 261 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2383  type II secretion system protein N  32.57 
 
 		 262 aa  97.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000842223 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2386  type II secretion system protein N  31.89 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0241  type II secretion system protein N  26.69 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335063  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1575  type II secretion system protein N  29.48 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.524365  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0151  type II secretion system protein N  24.07 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03966  putative general secretion pathway protein N  24.11 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0166  type II secretion system protein N  23.72 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3609  type II secretion system protein N  24.25 
 
 		 253 aa  52.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0161  type II secretion system protein N  23.32 
 
 		 253 aa  52.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0161  type II secretion system protein N  23.32 
 
 		 253 aa  52.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0176  general secretion pathway protein N  22.53 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0159  type II secretion system protein N  24.61 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4196  type II secretion system protein N  24.22 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.876892  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3391  type II secretion system protein N  26.69 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3228  general secretory pathway N transmembrane protein  30.61 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114308  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0163  type II secretion system protein N  24.61 
 
 		 253 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.105061 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0164  type II secretion system protein N  24.22 
 
 		 253 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001882  general secretion pathway protein N  26.79 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0131  type II secretion system protein N  23.62 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00611  general secretion pathway protein N  27.72 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2029  hypothetical protein  26.53 
 
 		 283 aa  45.8  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4348  type II secretion system protein N  23.08 
 
 		 252 aa  45.8  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.507417 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0179  general secretion pathway protein N  34.78 
 
 		 251 aa  45.4  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4490  putative general secretory pathway protein N  28.38 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.252228  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0107  type II secretion system protein N  24.03 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.692762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3557  type II secretion system protein N  23.14 
 
 		 253 aa  43.5  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2296  general secretion pathway protein N  27.47 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4581  general secretion pathway protein N  21.67 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3051  general secretory pathway N transmembrane protein  26.62 
 
 		 280 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.51549  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>