25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2386 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2386  type II secretion system protein N  100 
 
 		 277 aa  536  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2383  type II secretion system protein N  35.55 
 
 		 262 aa  119  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000842223 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1575  type II secretion system protein N  33.33 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.524365  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0238  type II secretion system protein N  31.82 
 
 		 261 aa  89  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0176  general secretion pathway protein N  24.18 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0163  type II secretion system protein N  25 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.105061 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0161  type II secretion system protein N  25.51 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0161  type II secretion system protein N  25.51 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0241  type II secretion system protein N  23.35 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335063  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3570  hypothetical protein  24 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.453301 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4196  type II secretion system protein N  26.02 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.876892  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0159  type II secretion system protein N  26.02 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0164  type II secretion system protein N  24.59 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3609  type II secretion system protein N  25.1 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0166  type II secretion system protein N  25.1 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0115  type II secretion system protein N  24.8 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3557  type II secretion system protein N  25 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0179  general secretion pathway protein N  33.75 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107927  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4581  general secretion pathway protein N  21.67 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0154  type II secretion system protein N  23.97 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0265405  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0131  type II secretion system protein N  26.51 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4724  type II secretion system protein N  28.42 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4348  type II secretion system protein N  25 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.507417 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03966  putative general secretion pathway protein N  23.44 
 
 		 254 aa  42.7  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0151  type II secretion system protein N  27.35 
 
 		 278 aa  42  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>