18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3570 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3570  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  512  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.453301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0241  type II secretion system protein N  27.71 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335063  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2386  type II secretion system protein N  24 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0115  type II secretion system protein N  25.9 
 
 		 253 aa  52.8  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0164  type II secretion system protein N  25.4 
 
 		 253 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0176  general secretion pathway protein N  24.6 
 
 		 253 aa  52  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0131  type II secretion system protein N  24.39 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4196  type II secretion system protein N  25.4 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.876892  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0159  type II secretion system protein N  25.4 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0163  type II secretion system protein N  25.4 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.105061 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2383  type II secretion system protein N  24.5 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000842223 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4581  general secretion pathway protein N  28.34 
 
 		 251 aa  48.9  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0161  type II secretion system protein N  23.81 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0161  type II secretion system protein N  23.81 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3557  type II secretion system protein N  23.6 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0166  type II secretion system protein N  23.81 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0179  general secretion pathway protein N  23.51 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0107  type II secretion system protein N  24.4 
 
 		 250 aa  43.5  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.692762  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>