57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4344 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  80.97 
 
 
280 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  61.19 
 
 
268 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  59.7 
 
 
276 aa  324  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  58.96 
 
 
270 aa  315  6e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  58.96 
 
 
270 aa  315  6e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  58.37 
 
 
262 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  38.63 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  38.63 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  38.63 
 
 
268 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  38.7 
 
 
265 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  38.15 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2221  hypothetical protein  38.15 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986001  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  36.73 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2455  hypothetical protein  34.04 
 
 
287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  35.41 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  36.03 
 
 
276 aa  131  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2151  hypothetical protein  35.63 
 
 
276 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  28.62 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2000  hypothetical protein  28.62 
 
 
271 aa  117  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.422215  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  34.83 
 
 
256 aa  116  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  32.82 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  31.73 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1720  hypothetical protein  28.67 
 
 
271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10540  hypothetical protein  32.57 
 
 
288 aa  112  5e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11001  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0454  hypothetical protein  31.13 
 
 
258 aa  109  5e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15480  hypothetical protein  31.25 
 
 
276 aa  109  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00643859  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1417  hypothetical protein  29.92 
 
 
254 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2774  hypothetical protein  32.84 
 
 
269 aa  102  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  31.11 
 
 
264 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7017  hypothetical protein  30.47 
 
 
291 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320155 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  28.93 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  31.1 
 
 
258 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  31.13 
 
 
263 aa  92.4  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  31.56 
 
 
267 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  28.79 
 
 
265 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1778  hypothetical protein  28.73 
 
 
256 aa  89  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00279828  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1506  hypothetical protein  30.74 
 
 
263 aa  89  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.168782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0790  hypothetical protein  26.74 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  29.5 
 
 
257 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  28.81 
 
 
270 aa  85.9  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  29.23 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  27.97 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0062  hypothetical protein  27.04 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.847776  normal  0.0297452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0053  hypothetical protein  27.04 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0984909  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0043  hypothetical protein  27.04 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257103  normal  0.0357536 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  27.86 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  27.52 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2565  hypothetical protein  26.3 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2573  hypothetical protein  26.3 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2528  hypothetical protein  26.3 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4522  hypothetical protein  27.74 
 
 
284 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0060  hypothetical protein  24.2 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4413  hypothetical protein  25.94 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0436871  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3381  hypothetical protein  34.78 
 
 
277 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981004  normal  0.259462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3647  hypothetical protein  25.4 
 
 
265 aa  49.3  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.51576  hitchhiker  0.00000000000126361 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3942  hypothetical protein  31.02 
 
 
260 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>