55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3381 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3381  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  563  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981004  normal  0.259462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  77.98 
 
 
277 aa  442  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2573  hypothetical protein  61.15 
 
 
270 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2528  hypothetical protein  61.15 
 
 
270 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2565  hypothetical protein  61.15 
 
 
270 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4413  hypothetical protein  45.17 
 
 
285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0436871  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3942  hypothetical protein  39.04 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  36.96 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0053  hypothetical protein  36.76 
 
 
276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0984909  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0043  hypothetical protein  36.76 
 
 
276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257103  normal  0.0357536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0062  hypothetical protein  36.76 
 
 
276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.847776  normal  0.0297452 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4522  hypothetical protein  36.15 
 
 
284 aa  139  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0060  hypothetical protein  35.91 
 
 
268 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0790  hypothetical protein  34.1 
 
 
268 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  29.28 
 
 
264 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  24.42 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  26.72 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  26.98 
 
 
263 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  25.1 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  27.27 
 
 
280 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  26 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  24.18 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  27.55 
 
 
263 aa  60.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  25.2 
 
 
257 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1506  hypothetical protein  25.69 
 
 
263 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.168782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  24.71 
 
 
276 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  24.17 
 
 
270 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  25.48 
 
 
265 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  27.57 
 
 
267 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  24.81 
 
 
268 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  25 
 
 
256 aa  55.8  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  23.31 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  24.8 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1720  hypothetical protein  24.05 
 
 
271 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  26.58 
 
 
276 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1778  hypothetical protein  26.75 
 
 
256 aa  53.1  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00279828  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  30.84 
 
 
270 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  30.84 
 
 
270 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  30.84 
 
 
262 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2000  hypothetical protein  25.1 
 
 
271 aa  52.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.422215  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1417  hypothetical protein  22.58 
 
 
254 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2151  hypothetical protein  23.46 
 
 
276 aa  50.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2221  hypothetical protein  27.02 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986001  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  25.77 
 
 
264 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15480  hypothetical protein  22.73 
 
 
276 aa  46.2  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00643859  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  23.29 
 
 
267 aa  45.8  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0454  hypothetical protein  26.88 
 
 
258 aa  45.8  0.0009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7017  hypothetical protein  24.71 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320155 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3647  hypothetical protein  26.85 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.51576  hitchhiker  0.00000000000126361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  24.03 
 
 
268 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  24.03 
 
 
268 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  24.03 
 
 
268 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  29.31 
 
 
533 aa  43.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  24.41 
 
 
267 aa  43.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  21.95 
 
 
267 aa  42.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>