57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0865 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  93.39 
 
 		 257 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  83.27 
 
 		 257 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  68.09 
 
 		 265 aa  362  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  58.75 
 
 		 263 aa  308  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  38.17 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  34.12 
 
 		 270 aa  149  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2221  hypothetical protein  35.57 
 
 		 256 aa  142  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986001  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  33.58 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  34.62 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  34.68 
 
 		 276 aa  132  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  33.61 
 
 		 262 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  32.67 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0454  hypothetical protein  30.16 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  30.65 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  30.8 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  30.8 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  30.8 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  30.38 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1506  hypothetical protein  30.68 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.168782 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  26.88 
 
 		 267 aa  105  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  27.56 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  29.06 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15480  hypothetical protein  28.4 
 
 		 276 aa  102  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00643859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  32.37 
 
 		 268 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1778  hypothetical protein  29.85 
 
 		 256 aa  95.9  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00279828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10540  hypothetical protein  29.81 
 
 		 288 aa  94.7  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11001  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  29.69 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1720  hypothetical protein  27.17 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  30.27 
 
 		 280 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0062  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.847776  normal  0.0297452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0053  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0984909  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2000  hypothetical protein  26.77 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.422215  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0043  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257103  normal  0.0357536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  30.71 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  30.71 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  30.71 
 
 		 262 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1417  hypothetical protein  28.51 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  28.25 
 
 		 256 aa  85.9  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  27.82 
 
 		 272 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2774  hypothetical protein  29.39 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  29.23 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  26.15 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2151  hypothetical protein  28.46 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7017  hypothetical protein  29.63 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320155 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  26.38 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2455  hypothetical protein  26.4 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0790  hypothetical protein  28.08 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2528  hypothetical protein  28.64 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2573  hypothetical protein  28.64 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2565  hypothetical protein  28.71 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0060  hypothetical protein  25.97 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3942  hypothetical protein  25.61 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3647  hypothetical protein  25.29 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.51576  hitchhiker  0.00000000000126361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4522  hypothetical protein  27.12 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4413  hypothetical protein  25.7 
 
 		 285 aa  49.3  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0436871  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3381  hypothetical protein  24.42 
 
 		 277 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981004  normal  0.259462 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>