55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2330 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  550  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  40.74 
 
 		 263 aa  171  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  38.67 
 
 		 265 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  38.02 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  39.1 
 
 		 263 aa  162  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  36.33 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  36.21 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  34.12 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  37.55 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  40.16 
 
 		 276 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2221  hypothetical protein  35.61 
 
 		 256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986001  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  34.21 
 
 		 262 aa  131  9e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  31.52 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  32.46 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  31.75 
 
 		 268 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  32.31 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  31.94 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  31.66 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  31.66 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  31.66 
 
 		 268 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  29.81 
 
 		 258 aa  109  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  30.43 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1417  hypothetical protein  33.2 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  30.08 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  29.96 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1506  hypothetical protein  28.68 
 
 		 263 aa  95.9  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.168782 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  29.96 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  29.96 
 
 		 270 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  29.96 
 
 		 270 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3647  hypothetical protein  30.13 
 
 		 265 aa  89.4  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.51576  hitchhiker  0.00000000000126361 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2455  hypothetical protein  26.91 
 
 		 287 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  28.81 
 
 		 269 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2774  hypothetical protein  30.19 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0454  hypothetical protein  26.34 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2151  hypothetical protein  28.31 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1778  hypothetical protein  29.28 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00279828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  30.74 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15480  hypothetical protein  25.79 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00643859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7017  hypothetical protein  29.27 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0043  hypothetical protein  27.76 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257103  normal  0.0357536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0053  hypothetical protein  27.76 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0984909  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0062  hypothetical protein  27.76 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.847776  normal  0.0297452 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10540  hypothetical protein  28.16 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11001  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  23.9 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  28.85 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0790  hypothetical protein  23.62 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0060  hypothetical protein  25.28 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1720  hypothetical protein  22.62 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2000  hypothetical protein  22.83 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.422215  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2565  hypothetical protein  24.22 
 
 		 270 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2528  hypothetical protein  24.22 
 
 		 270 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2573  hypothetical protein  24.22 
 
 		 270 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  20.38 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3381  hypothetical protein  23.31 
 
 		 277 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981004  normal  0.259462 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4413  hypothetical protein  31.11 
 
 		 285 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0436871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>