54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0667 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  534  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2221  hypothetical protein  48.46 
 
 
256 aa  199  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986001  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  49.06 
 
 
263 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  42.59 
 
 
267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  42.97 
 
 
265 aa  162  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  40.24 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  39.84 
 
 
268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  39.84 
 
 
268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  40.86 
 
 
264 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  34.88 
 
 
276 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  36.65 
 
 
257 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  35.38 
 
 
268 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  39.44 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  36.47 
 
 
270 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  36.47 
 
 
270 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  40.16 
 
 
270 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  36.08 
 
 
262 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  35.71 
 
 
257 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  37.69 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0454  hypothetical protein  33.46 
 
 
258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  35.77 
 
 
263 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  34.68 
 
 
257 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  36.03 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  32.39 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  38.49 
 
 
267 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  36.82 
 
 
264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  34.01 
 
 
267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  36.84 
 
 
258 aa  119  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1720  hypothetical protein  28.89 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  31.47 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2000  hypothetical protein  28.89 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.422215  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  33.07 
 
 
256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10540  hypothetical protein  30.63 
 
 
288 aa  112  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11001  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2151  hypothetical protein  33.72 
 
 
276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2774  hypothetical protein  38.4 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1417  hypothetical protein  32.81 
 
 
254 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1778  hypothetical protein  33.73 
 
 
256 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00279828  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1506  hypothetical protein  32.03 
 
 
263 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.168782 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2455  hypothetical protein  32.39 
 
 
287 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15480  hypothetical protein  29.39 
 
 
276 aa  104  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00643859  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  28.94 
 
 
270 aa  100  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7017  hypothetical protein  30.12 
 
 
291 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  29.03 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4413  hypothetical protein  24.48 
 
 
285 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0436871  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4522  hypothetical protein  29.57 
 
 
284 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  27.23 
 
 
277 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0062  hypothetical protein  29.22 
 
 
276 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.847776  normal  0.0297452 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0043  hypothetical protein  29.22 
 
 
276 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257103  normal  0.0357536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0053  hypothetical protein  29.22 
 
 
276 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0984909  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2573  hypothetical protein  24.14 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2528  hypothetical protein  24.14 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2565  hypothetical protein  24.26 
 
 
270 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3942  hypothetical protein  25.83 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0060  hypothetical protein  26.61 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.215016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>