58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0968 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  528  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  59.53 
 
 
257 aa  314  8e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  58.75 
 
 
257 aa  308  5e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  58.37 
 
 
257 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  57.98 
 
 
265 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  39.83 
 
 
264 aa  172  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  40.74 
 
 
270 aa  171  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  36.59 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  36.19 
 
 
263 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2221  hypothetical protein  34.38 
 
 
256 aa  135  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986001  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  35.77 
 
 
276 aa  132  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0454  hypothetical protein  32.94 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  31.52 
 
 
262 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  32.94 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  30.25 
 
 
267 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  30.58 
 
 
267 aa  106  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  30.08 
 
 
267 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  32.92 
 
 
280 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  31.08 
 
 
268 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  30.43 
 
 
268 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  30.43 
 
 
268 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  30.43 
 
 
268 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  29.08 
 
 
276 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  29.02 
 
 
265 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1720  hypothetical protein  29.72 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2151  hypothetical protein  31.1 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  29.06 
 
 
264 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15480  hypothetical protein  28.68 
 
 
276 aa  92.8  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00643859  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  31.13 
 
 
269 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  30 
 
 
256 aa  90.5  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1506  hypothetical protein  31.15 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.168782 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  30.16 
 
 
270 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  30.16 
 
 
270 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  30.16 
 
 
262 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2000  hypothetical protein  29.2 
 
 
271 aa  89.7  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.422215  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0062  hypothetical protein  31.67 
 
 
276 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.847776  normal  0.0297452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0053  hypothetical protein  31.67 
 
 
276 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0984909  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0043  hypothetical protein  31.67 
 
 
276 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257103  normal  0.0357536 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1417  hypothetical protein  27.38 
 
 
254 aa  86.3  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1778  hypothetical protein  29.77 
 
 
256 aa  85.9  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00279828  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2455  hypothetical protein  28.29 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  28.34 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10540  hypothetical protein  29.13 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11001  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2774  hypothetical protein  31.52 
 
 
269 aa  77  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  28.35 
 
 
272 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7017  hypothetical protein  27.73 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  26.81 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0790  hypothetical protein  28.99 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0060  hypothetical protein  27.09 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3647  hypothetical protein  27.17 
 
 
265 aa  62.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.51576  hitchhiker  0.00000000000126361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2528  hypothetical protein  27.87 
 
 
270 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2573  hypothetical protein  27.87 
 
 
270 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2565  hypothetical protein  27.87 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4522  hypothetical protein  27.82 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3942  hypothetical protein  27.08 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4413  hypothetical protein  26.8 
 
 
285 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0436871  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3381  hypothetical protein  26.98 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981004  normal  0.259462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1248  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 
279 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>