56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2017 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  99.24 
 
 
262 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  81.18 
 
 
276 aa  449  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  81.72 
 
 
268 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  58.96 
 
 
269 aa  315  6e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  57.99 
 
 
280 aa  314  8e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  40 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  40.45 
 
 
264 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  41.57 
 
 
268 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  41.57 
 
 
268 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  41.57 
 
 
268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2221  hypothetical protein  40.15 
 
 
256 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986001  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  39.05 
 
 
263 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  39.45 
 
 
267 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  34.47 
 
 
267 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2455  hypothetical protein  34.3 
 
 
287 aa  143  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  35.09 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2151  hypothetical protein  37.32 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2774  hypothetical protein  37.83 
 
 
269 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  36.47 
 
 
276 aa  138  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15480  hypothetical protein  31.84 
 
 
276 aa  137  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00643859  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2000  hypothetical protein  33.21 
 
 
271 aa  138  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.422215  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7017  hypothetical protein  35.29 
 
 
291 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320155 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1720  hypothetical protein  32.73 
 
 
271 aa  136  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  32.38 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10540  hypothetical protein  34.18 
 
 
288 aa  132  6.999999999999999e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11001  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  34.96 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1506  hypothetical protein  33.21 
 
 
263 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.168782 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1417  hypothetical protein  30.31 
 
 
254 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1778  hypothetical protein  32.71 
 
 
256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00279828  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0454  hypothetical protein  34.6 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  31.23 
 
 
258 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  33.7 
 
 
267 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  29.26 
 
 
262 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  30.86 
 
 
264 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  29.96 
 
 
270 aa  94  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  30.16 
 
 
263 aa  89.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  27.01 
 
 
265 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  30.71 
 
 
257 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  29.34 
 
 
257 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  30.24 
 
 
257 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  29.62 
 
 
272 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0043  hypothetical protein  28.63 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257103  normal  0.0357536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0062  hypothetical protein  28.63 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.847776  normal  0.0297452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0053  hypothetical protein  28.63 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0984909  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0790  hypothetical protein  29.1 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  27.48 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0060  hypothetical protein  27.31 
 
 
268 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4522  hypothetical protein  28.57 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2573  hypothetical protein  31.18 
 
 
270 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2565  hypothetical protein  31.18 
 
 
270 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2528  hypothetical protein  31.18 
 
 
270 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3647  hypothetical protein  27.17 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.51576  hitchhiker  0.00000000000126361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3381  hypothetical protein  30.84 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981004  normal  0.259462 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4413  hypothetical protein  30.38 
 
 
285 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0436871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>