56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0712 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  68.48 
 
 		 257 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  69.26 
 
 		 257 aa  367  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  68.09 
 
 		 257 aa  362  3e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  57.98 
 
 		 263 aa  304  8.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  38.67 
 
 		 270 aa  169  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  33.71 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2221  hypothetical protein  32.05 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986001  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  32.58 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  32.39 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  31.46 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0454  hypothetical protein  29.25 
 
 		 258 aa  121  9e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  30.68 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  30.2 
 
 		 268 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  30.2 
 
 		 268 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  30.2 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  27.38 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  29.1 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  27.39 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  27.59 
 
 		 258 aa  99.8  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15480  hypothetical protein  29.17 
 
 		 276 aa  99.8  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00643859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1720  hypothetical protein  29.44 
 
 		 271 aa  99  7e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  28.79 
 
 		 267 aa  98.6  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  27.94 
 
 		 264 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  31.15 
 
 		 280 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  26.37 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  27.55 
 
 		 268 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2000  hypothetical protein  29.03 
 
 		 271 aa  92.8  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.422215  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1506  hypothetical protein  28.24 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.168782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  27.01 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  28.79 
 
 		 269 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  27.01 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1778  hypothetical protein  27.78 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00279828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  28 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10540  hypothetical protein  27.91 
 
 		 288 aa  86.7  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11001  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0043  hypothetical protein  29.89 
 
 		 276 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257103  normal  0.0357536 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  27.59 
 
 		 256 aa  85.5  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0062  hypothetical protein  29.89 
 
 		 276 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.847776  normal  0.0297452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0053  hypothetical protein  29.89 
 
 		 276 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0984909  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1417  hypothetical protein  25.97 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  24.91 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2151  hypothetical protein  28.69 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3647  hypothetical protein  27.59 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.51576  hitchhiker  0.00000000000126361 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  22.92 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2455  hypothetical protein  24.51 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2528  hypothetical protein  27.13 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2573  hypothetical protein  27.13 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2565  hypothetical protein  27.16 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  24.9 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2774  hypothetical protein  26.23 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7017  hypothetical protein  25.91 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0790  hypothetical protein  25.38 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0060  hypothetical protein  24.81 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3942  hypothetical protein  25.2 
 
 		 260 aa  48.9  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4413  hypothetical protein  25.09 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0436871  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4522  hypothetical protein  24.71 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>