50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2000 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2000  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  558  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.422215  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1720  hypothetical protein  97.05 
 
 
271 aa  542  1e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  71.38 
 
 
270 aa  402  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  49.59 
 
 
267 aa  249  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  48.58 
 
 
267 aa  247  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10540  hypothetical protein  42.96 
 
 
288 aa  222  4.9999999999999996e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11001  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7017  hypothetical protein  41.86 
 
 
291 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320155 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15480  hypothetical protein  40.96 
 
 
276 aa  204  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00643859  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1506  hypothetical protein  43.37 
 
 
263 aa  201  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.168782 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2774  hypothetical protein  40.87 
 
 
269 aa  199  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1417  hypothetical protein  39.76 
 
 
254 aa  179  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  38.61 
 
 
256 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1778  hypothetical protein  37.35 
 
 
256 aa  169  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00279828  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2221  hypothetical protein  31.85 
 
 
256 aa  148  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986001  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  32.97 
 
 
270 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  32.97 
 
 
270 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  34.63 
 
 
262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  33.96 
 
 
276 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  32.38 
 
 
268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  30.16 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  30.71 
 
 
280 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  28.62 
 
 
269 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  28.89 
 
 
276 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  33.59 
 
 
258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  30.35 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  30.38 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  30.38 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  31.85 
 
 
267 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  31.72 
 
 
267 aa  109  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  29.66 
 
 
265 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2455  hypothetical protein  31.8 
 
 
287 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  29.81 
 
 
264 aa  106  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  30.47 
 
 
262 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2151  hypothetical protein  27.99 
 
 
276 aa  102  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0454  hypothetical protein  28.46 
 
 
258 aa  97.8  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  27.71 
 
 
257 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  29.03 
 
 
265 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  26.77 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  26.77 
 
 
257 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  29.2 
 
 
263 aa  89.7  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  25 
 
 
264 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  24.31 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2565  hypothetical protein  23.57 
 
 
270 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2573  hypothetical protein  23.57 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2528  hypothetical protein  23.57 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  22.83 
 
 
270 aa  56.2  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  24.58 
 
 
277 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0790  hypothetical protein  23.14 
 
 
268 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3647  hypothetical protein  32.76 
 
 
265 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.51576  hitchhiker  0.00000000000126361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0060  hypothetical protein  20.07 
 
 
268 aa  42.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.215016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>