49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4522 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4522  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  566  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  40.23 
 
 
277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4413  hypothetical protein  38.73 
 
 
285 aa  172  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0436871  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2565  hypothetical protein  39.93 
 
 
270 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2573  hypothetical protein  39.93 
 
 
270 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2528  hypothetical protein  39.93 
 
 
270 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  37.02 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0790  hypothetical protein  35.4 
 
 
268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0062  hypothetical protein  33.94 
 
 
276 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.847776  normal  0.0297452 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0043  hypothetical protein  33.94 
 
 
276 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257103  normal  0.0357536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0053  hypothetical protein  33.94 
 
 
276 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0984909  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3381  hypothetical protein  36.15 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981004  normal  0.259462 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3942  hypothetical protein  33.05 
 
 
260 aa  116  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0060  hypothetical protein  34.35 
 
 
268 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  32.65 
 
 
264 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  31.78 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  29.63 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  30.8 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  30.8 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0454  hypothetical protein  27.48 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  28.47 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  29.57 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  31.8 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  28.78 
 
 
280 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  28.57 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  28.57 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  29.77 
 
 
256 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  28.21 
 
 
262 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  28.4 
 
 
263 aa  63.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1506  hypothetical protein  28.19 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.168782 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1417  hypothetical protein  26.56 
 
 
254 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2221  hypothetical protein  28.99 
 
 
256 aa  59.3  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986001  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  28.99 
 
 
257 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  26.07 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  27.12 
 
 
257 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  26.77 
 
 
263 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  27.47 
 
 
276 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  23.79 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  28.88 
 
 
268 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1778  hypothetical protein  24.71 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00279828  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  25.48 
 
 
265 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  27.98 
 
 
267 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  25.59 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  25.32 
 
 
267 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  25.44 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  24.14 
 
 
270 aa  46.2  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2000  hypothetical protein  20.6 
 
 
271 aa  44.3  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.422215  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  26.1 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7017  hypothetical protein  26.1 
 
 
291 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320155 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>