54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3063 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  528  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  84.53 
 
 
265 aa  448  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  78.57 
 
 
268 aa  407  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  78.95 
 
 
268 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  78.57 
 
 
268 aa  407  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  40.45 
 
 
270 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  40.45 
 
 
270 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  40.93 
 
 
262 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  40.66 
 
 
268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  38.75 
 
 
276 aa  169  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  39.11 
 
 
280 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  40.86 
 
 
276 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2151  hypothetical protein  39.31 
 
 
276 aa  149  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  38.15 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  35.93 
 
 
263 aa  146  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2221  hypothetical protein  36.47 
 
 
256 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986001  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  37.5 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  37.97 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2455  hypothetical protein  35.91 
 
 
287 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  35.86 
 
 
267 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  35.21 
 
 
262 aa  123  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1778  hypothetical protein  36.43 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00279828  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  32.71 
 
 
270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  32.97 
 
 
267 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  31.94 
 
 
270 aa  112  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1417  hypothetical protein  32.95 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  33.21 
 
 
256 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1720  hypothetical protein  30.22 
 
 
271 aa  110  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  32.39 
 
 
264 aa  109  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  33.47 
 
 
267 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7017  hypothetical protein  32.43 
 
 
291 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320155 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2774  hypothetical protein  36.4 
 
 
269 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2000  hypothetical protein  29.81 
 
 
271 aa  106  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.422215  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  28.41 
 
 
257 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  29.06 
 
 
257 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  28.31 
 
 
257 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0454  hypothetical protein  29.12 
 
 
258 aa  99.4  5e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10540  hypothetical protein  31.48 
 
 
288 aa  99  7e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11001  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  27.94 
 
 
265 aa  98.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1506  hypothetical protein  31.75 
 
 
263 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.168782 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  29.06 
 
 
263 aa  92.8  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15480  hypothetical protein  26.64 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00643859  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  28.93 
 
 
272 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0062  hypothetical protein  31.13 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.847776  normal  0.0297452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0053  hypothetical protein  31.13 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0984909  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0043  hypothetical protein  31.13 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257103  normal  0.0357536 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4413  hypothetical protein  30.38 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0436871  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4522  hypothetical protein  31.8 
 
 
284 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3942  hypothetical protein  26.14 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3647  hypothetical protein  25.63 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.51576  hitchhiker  0.00000000000126361 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  24.9 
 
 
277 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0790  hypothetical protein  25.29 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4319  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.23 
 
 
469 aa  42.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  30.77 
 
 
184 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0484171 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>