53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3143 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3381  hypothetical protein  77.98 
 
 
277 aa  407  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981004  normal  0.259462 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2573  hypothetical protein  60.92 
 
 
270 aa  308  5e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2528  hypothetical protein  60.92 
 
 
270 aa  308  5e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2565  hypothetical protein  60.92 
 
 
270 aa  308  8e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4413  hypothetical protein  44.61 
 
 
285 aa  210  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0436871  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4522  hypothetical protein  40.23 
 
 
284 aa  167  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3942  hypothetical protein  39.13 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0043  hypothetical protein  37.13 
 
 
276 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257103  normal  0.0357536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0062  hypothetical protein  37.13 
 
 
276 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.847776  normal  0.0297452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0053  hypothetical protein  37.13 
 
 
276 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0984909  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  37.31 
 
 
272 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0060  hypothetical protein  36.19 
 
 
268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0790  hypothetical protein  35.5 
 
 
268 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  26.15 
 
 
257 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  29.67 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  29.49 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  25.2 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  27.52 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  29.89 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  27.48 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  27.48 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  27.48 
 
 
262 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  26.81 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  27.24 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  24.9 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  27.17 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  26.57 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  25.67 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3647  hypothetical protein  26.82 
 
 
265 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.51576  hitchhiker  0.00000000000126361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  23.64 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  25.87 
 
 
256 aa  60.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  25.2 
 
 
267 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  28.85 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  26.38 
 
 
268 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  26.38 
 
 
268 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  25.77 
 
 
268 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1720  hypothetical protein  24.79 
 
 
271 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2000  hypothetical protein  24.58 
 
 
271 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.422215  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1417  hypothetical protein  22.67 
 
 
254 aa  52.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  27.23 
 
 
276 aa  52.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1506  hypothetical protein  25.93 
 
 
263 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.168782 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0454  hypothetical protein  27.27 
 
 
258 aa  50.8  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  20.38 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  24.34 
 
 
265 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  22.67 
 
 
267 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2221  hypothetical protein  28.35 
 
 
256 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986001  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1778  hypothetical protein  25.1 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00279828  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  24.12 
 
 
267 aa  47  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  22.95 
 
 
267 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2151  hypothetical protein  30.77 
 
 
276 aa  45.8  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  24.9 
 
 
264 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15480  hypothetical protein  22.8 
 
 
276 aa  42  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00643859  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>