56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0579 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  556  1e-157  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2000  hypothetical protein  71.38 
 
 		 271 aa  402  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.422215  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1720  hypothetical protein  70.63 
 
 		 271 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  51.32 
 
 		 267 aa  263  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  50.76 
 
 		 267 aa  260  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10540  hypothetical protein  46.64 
 
 		 288 aa  219  6e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11001  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7017  hypothetical protein  42.02 
 
 		 291 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1506  hypothetical protein  44.4 
 
 		 263 aa  202  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.168782 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1417  hypothetical protein  43.37 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15480  hypothetical protein  40.73 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00643859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2774  hypothetical protein  41.9 
 
 		 269 aa  193  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  40.55 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1778  hypothetical protein  39.76 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00279828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  32.38 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  32.38 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  33.46 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2221  hypothetical protein  30.52 
 
 		 256 aa  128  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986001  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  32.97 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  30.47 
 
 		 280 aa  122  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  32.01 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  32.71 
 
 		 264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  29.64 
 
 		 263 aa  118  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  32.72 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  28.62 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  32.82 
 
 		 268 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  32.82 
 
 		 268 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  32.82 
 
 		 268 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  32.93 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2455  hypothetical protein  31.43 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  30.74 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2151  hypothetical protein  28.73 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  29.72 
 
 		 262 aa  102  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  28.94 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  29.69 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  29.37 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0454  hypothetical protein  28.05 
 
 		 258 aa  89  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  28.34 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  26.64 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  26.38 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  25 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0790  hypothetical protein  26.77 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  23.9 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  22.92 
 
 		 265 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  25.67 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0043  hypothetical protein  26.29 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257103  normal  0.0357536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0062  hypothetical protein  26.29 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.847776  normal  0.0297452 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  26.67 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0053  hypothetical protein  26.29 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0984909  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0060  hypothetical protein  23.62 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2565  hypothetical protein  23.92 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2528  hypothetical protein  23.92 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2573  hypothetical protein  23.92 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4522  hypothetical protein  23.79 
 
 		 284 aa  50.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3942  hypothetical protein  25.74 
 
 		 260 aa  49.3  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3647  hypothetical protein  24.08 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.51576  hitchhiker  0.00000000000126361 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4413  hypothetical protein  23.9 
 
 		 285 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0436871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>