52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2151 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2151  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  557  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  39.62 
 
 
265 aa  165  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  39.31 
 
 
264 aa  163  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  37.78 
 
 
268 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  37.78 
 
 
268 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  38.29 
 
 
268 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  36.92 
 
 
263 aa  155  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  38.61 
 
 
262 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  37.32 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  37.32 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  38.46 
 
 
268 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  37.07 
 
 
276 aa  148  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  36.78 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2221  hypothetical protein  35.04 
 
 
256 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986001  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2455  hypothetical protein  35.93 
 
 
287 aa  142  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  35.63 
 
 
269 aa  135  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15480  hypothetical protein  33.58 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00643859  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  33.22 
 
 
262 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  34.87 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1506  hypothetical protein  32.31 
 
 
263 aa  115  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.168782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  30.82 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1720  hypothetical protein  30.48 
 
 
271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7017  hypothetical protein  31.25 
 
 
291 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  30.91 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10540  hypothetical protein  32.37 
 
 
288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11001  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1778  hypothetical protein  32.82 
 
 
256 aa  109  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00279828  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  29.8 
 
 
267 aa  109  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2000  hypothetical protein  29.37 
 
 
271 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.422215  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  29.1 
 
 
270 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2774  hypothetical protein  33.2 
 
 
269 aa  105  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  30.98 
 
 
267 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  32.03 
 
 
267 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0454  hypothetical protein  29.75 
 
 
258 aa  103  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  31.01 
 
 
256 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1417  hypothetical protein  30.89 
 
 
254 aa  98.6  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  30.77 
 
 
264 aa  95.9  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  32.14 
 
 
263 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  30.55 
 
 
270 aa  86.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  29.7 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  27.78 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  29.03 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  28.46 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3647  hypothetical protein  27.92 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.51576  hitchhiker  0.00000000000126361 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4413  hypothetical protein  29.17 
 
 
285 aa  59.3  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0436871  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2565  hypothetical protein  27.52 
 
 
270 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2573  hypothetical protein  27.52 
 
 
270 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  25.72 
 
 
272 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2528  hypothetical protein  27.52 
 
 
270 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  23.95 
 
 
277 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0053  hypothetical protein  26.16 
 
 
276 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0984909  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0043  hypothetical protein  26.16 
 
 
276 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257103  normal  0.0357536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0062  hypothetical protein  26.16 
 
 
276 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.847776  normal  0.0297452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>