54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2774 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2774  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  520  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7017  hypothetical protein  60.66 
 
 
291 aa  308  5.9999999999999995e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1506  hypothetical protein  56.98 
 
 
263 aa  284  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.168782 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1417  hypothetical protein  50 
 
 
254 aa  239  5e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  48.64 
 
 
267 aa  236  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  47.27 
 
 
267 aa  231  7.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  49.41 
 
 
256 aa  228  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2000  hypothetical protein  41.09 
 
 
271 aa  212  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.422215  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15480  hypothetical protein  46.3 
 
 
276 aa  212  4.9999999999999996e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00643859  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1778  hypothetical protein  47.67 
 
 
256 aa  209  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00279828  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1720  hypothetical protein  41.54 
 
 
271 aa  208  7e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  41.86 
 
 
270 aa  202  4e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10540  hypothetical protein  45.35 
 
 
288 aa  195  8.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11001  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2221  hypothetical protein  42.41 
 
 
256 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986001  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  38.4 
 
 
263 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  38.98 
 
 
270 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  38.98 
 
 
270 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  38.98 
 
 
262 aa  148  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  38.98 
 
 
268 aa  146  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  37.4 
 
 
276 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  38.4 
 
 
276 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  38.1 
 
 
268 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  38.1 
 
 
268 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  37.7 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  36.84 
 
 
265 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  36.88 
 
 
262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  37.4 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  32.83 
 
 
280 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  35.66 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  33.09 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  31.32 
 
 
270 aa  105  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  32.82 
 
 
258 aa  105  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  33.46 
 
 
264 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2151  hypothetical protein  33.2 
 
 
276 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  33.84 
 
 
267 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  30.49 
 
 
257 aa  98.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  28.24 
 
 
257 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0454  hypothetical protein  32.43 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  30.24 
 
 
257 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  31.44 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2455  hypothetical protein  31.99 
 
 
287 aa  94  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  26.94 
 
 
265 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  28.7 
 
 
272 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3647  hypothetical protein  23.87 
 
 
265 aa  50.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.51576  hitchhiker  0.00000000000126361 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0062  hypothetical protein  29.02 
 
 
276 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.847776  normal  0.0297452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0053  hypothetical protein  29.02 
 
 
276 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0984909  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4522  hypothetical protein  27.46 
 
 
284 aa  50.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0043  hypothetical protein  29.02 
 
 
276 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257103  normal  0.0357536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0060  hypothetical protein  27.76 
 
 
268 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0790  hypothetical protein  30.13 
 
 
268 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2573  hypothetical protein  27.17 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2528  hypothetical protein  27.17 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2565  hypothetical protein  27.17 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  26.02 
 
 
277 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>