51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_15480 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_15480  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  553  1e-157  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00643859  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  44.44 
 
 
267 aa  227  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  44.66 
 
 
267 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7017  hypothetical protein  45.04 
 
 
291 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320155 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1720  hypothetical protein  42.23 
 
 
271 aa  208  6e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1778  hypothetical protein  43.14 
 
 
256 aa  207  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00279828  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1506  hypothetical protein  41.47 
 
 
263 aa  205  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.168782 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2000  hypothetical protein  40.96 
 
 
271 aa  204  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.422215  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10540  hypothetical protein  41.13 
 
 
288 aa  202  4e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11001  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2774  hypothetical protein  46.3 
 
 
269 aa  195  7e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  40.73 
 
 
270 aa  194  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1417  hypothetical protein  40.16 
 
 
254 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  37.01 
 
 
256 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  36.29 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2221  hypothetical protein  34.65 
 
 
256 aa  155  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986001  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  31.84 
 
 
270 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  31.84 
 
 
270 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  33.73 
 
 
276 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  32.54 
 
 
262 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  33.2 
 
 
268 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  29.18 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2151  hypothetical protein  33.58 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  31.95 
 
 
267 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  31.87 
 
 
267 aa  112  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  30.97 
 
 
262 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  30.77 
 
 
264 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  31.25 
 
 
269 aa  109  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  29.71 
 
 
280 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  29.39 
 
 
276 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  28.4 
 
 
257 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  28.22 
 
 
257 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  29.17 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0454  hypothetical protein  28.74 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  29.83 
 
 
257 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  27.67 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  27.67 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  27.67 
 
 
268 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2455  hypothetical protein  27.24 
 
 
287 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  27.45 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  28.68 
 
 
263 aa  92.8  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  26.64 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  25.79 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3647  hypothetical protein  24.63 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.51576  hitchhiker  0.00000000000126361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2565  hypothetical protein  25.1 
 
 
270 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2528  hypothetical protein  25.1 
 
 
270 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2573  hypothetical protein  25.1 
 
 
270 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0060  hypothetical protein  35.92 
 
 
268 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0790  hypothetical protein  27.71 
 
 
268 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  26.7 
 
 
272 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  24.3 
 
 
270 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  22.8 
 
 
277 aa  42  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>