111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4462 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008243  Meso_4462  transposase  100 
 
 
128 aa  265  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.344074  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4558  transposase  61.95 
 
 
215 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  38.52 
 
 
341 aa  79.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  38.52 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  36.89 
 
 
243 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  37.5 
 
 
238 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  36.67 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  36.67 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3358  integrase catalytic region  35.19 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  31.62 
 
 
222 aa  67  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  35.65 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  36.94 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  34.26 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  34.43 
 
 
228 aa  64.7  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  34.43 
 
 
228 aa  64.7  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3336  IS240 transposase  33.03 
 
 
202 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1619  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  34.43 
 
 
228 aa  64.7  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  38.02 
 
 
236 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  34.43 
 
 
228 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  34.26 
 
 
235 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4509  transposase  79.41 
 
 
116 aa  61.6  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  35.78 
 
 
227 aa  56.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  29.51 
 
 
230 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.51 
 
 
230 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.51 
 
 
230 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  29.51 
 
 
230 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000673893  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  29.08 
 
 
235 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  26.95 
 
 
235 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  28.87 
 
 
238 aa  53.9  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  29.46 
 
 
235 aa  52.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  29.2 
 
 
302 aa  52.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7085  transposase  30.16 
 
 
222 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0314847  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0249  IS431mec-like transposase  33.33 
 
 
224 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 
264 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  28.57 
 
 
254 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  28.57 
 
 
254 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  27.12 
 
 
255 aa  48.9  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7154  transposase  30 
 
 
224 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1579  IS431mec-like transposase  33.33 
 
 
224 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2526  IS431mec-like transposase  33.33 
 
 
224 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000275342  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0008  IS431mec-like transposase  33.33 
 
 
224 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297638  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0020  IS431mec-like transposase  33.33 
 
 
224 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0021  truncated IS431mec-like transposase  33.33 
 
 
208 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2758  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
224 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2763  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
224 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.776965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0026  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
224 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.159143  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  33.33 
 
 
224 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  33.33 
 
 
224 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0026  integrase catalytic region  33.33 
 
 
224 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.509582  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  33.33 
 
 
214 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C41  transposase  31.96 
 
 
226 aa  45.4  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  31.96 
 
 
226 aa  45.4  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  27.35 
 
 
250 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  31.36 
 
 
240 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2739  integrase catalytic subunit  31.96 
 
 
221 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2740  integrase catalytic subunit  32.29 
 
 
224 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2815  integrase catalytic region  31.96 
 
 
221 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.411277  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2817  integrase catalytic region  32.29 
 
 
224 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264347  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  31.36 
 
 
234 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  31.36 
 
 
234 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  31.36 
 
 
234 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.42 
 
 
346 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  31.36 
 
 
234 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0105  ISSod8, transposase  28.3 
 
 
185 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  34.34 
 
 
226 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  31.96 
 
 
226 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  27.87 
 
 
250 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  28.69 
 
 
250 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  28.23 
 
 
250 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  28.23 
 
 
250 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0063  ISSod8, transposase  28.3 
 
 
185 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.372655  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  31.36 
 
 
240 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  31.36 
 
 
240 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  31.36 
 
 
240 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  31.36 
 
 
240 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  31.36 
 
 
240 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  31.36 
 
 
240 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  31.36 
 
 
240 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  31.36 
 
 
240 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  31.36 
 
 
240 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  31.36 
 
 
240 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  31.36 
 
 
240 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  31.36 
 
 
240 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0613  hypothetical protein  26.95 
 
 
235 aa  45.1  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  31.36 
 
 
234 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  31.36 
 
 
234 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  31.36 
 
 
234 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  31.36 
 
 
234 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  31.36 
 
 
234 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  31.36 
 
 
234 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  31.36 
 
 
234 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  31.36 
 
 
234 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  27.87 
 
 
250 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  30.69 
 
 
206 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  26.61 
 
 
218 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  29.63 
 
 
237 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  32.29 
 
 
237 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  28.33 
 
 
250 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  31.25 
 
 
224 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  32.29 
 
 
236 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>