61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4509 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008243  Meso_4509  transposase  100 
 
 
116 aa  238  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  52.17 
 
 
243 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  56.36 
 
 
235 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  56.36 
 
 
235 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3336  IS240 transposase  56.36 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1619  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  56.6 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3358  integrase catalytic region  58.49 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  56.6 
 
 
235 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  59.62 
 
 
341 aa  67.4  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  59.62 
 
 
263 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  50 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  47.06 
 
 
212 aa  62  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  47.06 
 
 
238 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  62.5 
 
 
228 aa  61.6  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  62.5 
 
 
228 aa  61.6  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  62.5 
 
 
228 aa  61.6  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4462  transposase  79.41 
 
 
128 aa  61.6  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.344074  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  54.9 
 
 
222 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4558  transposase  79.41 
 
 
215 aa  60.8  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  58.93 
 
 
228 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  52.73 
 
 
227 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  59.52 
 
 
236 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  39.71 
 
 
230 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000673893  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.71 
 
 
230 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.71 
 
 
230 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  39.71 
 
 
230 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  44.07 
 
 
240 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  44.07 
 
 
234 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  44.07 
 
 
234 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  44.07 
 
 
234 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  44.07 
 
 
240 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  44.07 
 
 
234 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  44.07 
 
 
234 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  44.07 
 
 
234 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  44.07 
 
 
234 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  44.07 
 
 
234 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  44.07 
 
 
240 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  44.07 
 
 
240 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  44.07 
 
 
240 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  44.07 
 
 
240 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  44.07 
 
 
240 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  44.07 
 
 
240 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  44.07 
 
 
240 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  44.07 
 
 
240 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  44.07 
 
 
240 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  44.07 
 
 
240 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  44.07 
 
 
234 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  44.07 
 
 
240 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  44.07 
 
 
234 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  44.07 
 
 
234 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  44.07 
 
 
234 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  43.75 
 
 
235 aa  44.3  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  43.75 
 
 
302 aa  43.9  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  38.46 
 
 
255 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  40.74 
 
 
235 aa  42.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7085  transposase  40.38 
 
 
222 aa  42  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0314847  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  41.67 
 
 
235 aa  42.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  41.18 
 
 
264 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  41.18 
 
 
254 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  41.18 
 
 
254 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  37.04 
 
 
238 aa  40.8  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>