93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1590 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1590  cyclase family protein  100 
 
 
222 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0915  cyclase family protein  32.03 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0937  cyclase family protein  32.03 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.227142  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1598  putative cyclase  28.25 
 
 
223 aa  85.9  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0561812  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  26.39 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  26.39 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  31.34 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  29.05 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  30.88 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1882  cyclase family protein  28.12 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  30.88 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  29.63 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  30.88 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  30.41 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  30.41 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  29.63 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  30.41 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  26.75 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  26.55 
 
 
209 aa  63.2  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  29.95 
 
 
209 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  26.82 
 
 
226 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0059  cyclase family protein  26.48 
 
 
213 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  29.95 
 
 
209 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  28.37 
 
 
226 aa  62.8  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  29.55 
 
 
219 aa  61.6  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  26.03 
 
 
214 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  29.73 
 
 
226 aa  59.3  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  32.31 
 
 
227 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  27.32 
 
 
243 aa  58.9  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  27.19 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  26.39 
 
 
214 aa  57  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0414  cyclase family protein  29.01 
 
 
267 aa  56.2  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  26.58 
 
 
237 aa  55.5  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  24.89 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  27.4 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  29.63 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  25.68 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  28.57 
 
 
213 aa  52  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  28.99 
 
 
275 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0384767 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  24.23 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  27.17 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  31.91 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0711  cyclase, putative  27.78 
 
 
255 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.442327  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  29.52 
 
 
275 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0809  putative cyclase  27.98 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  27.56 
 
 
215 aa  50.1  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0720  arylformamidase  25.11 
 
 
213 aa  48.9  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  28.51 
 
 
224 aa  49.3  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  24.34 
 
 
217 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2496  arylformamidase  25.58 
 
 
213 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605648  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2625  cyclase family protein  25.58 
 
 
213 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2577  cyclase family protein  24.65 
 
 
213 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1966  putative cyclase  24.65 
 
 
213 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0789774  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  27.68 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5908  putative cyclase  25.12 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  27.31 
 
 
229 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  24.34 
 
 
290 aa  46.6  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2601  arylformamidase  24.65 
 
 
213 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  22.83 
 
 
212 aa  46.2  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  28 
 
 
209 aa  45.8  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  26.09 
 
 
201 aa  45.8  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  23.48 
 
 
210 aa  45.8  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0508  arylformamidase  26.79 
 
 
209 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24803  normal  0.0492636 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  24.66 
 
 
215 aa  45.8  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  30.11 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0897  arylformamidase  27.06 
 
 
242 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102698  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  24.63 
 
 
249 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  26.06 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0564  cyclase family protein  25.38 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0100  arylformamidase  27.56 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0282167  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0652  arylformamidase  27.56 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.228367  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2438  arylformamidase  30.26 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2487  arylformamidase  27.56 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0353  cyclase, putative  27.56 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1055  cyclase, putative  27.06 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  24.71 
 
 
205 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  26.13 
 
 
208 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  26.13 
 
 
208 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  30.94 
 
 
284 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1157  cyclase family protein  31.25 
 
 
216 aa  42.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0894  arylformamidase  31.75 
 
 
242 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329738  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0735  kynureninase  29.07 
 
 
212 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  27.47 
 
 
222 aa  42.4  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  30.23 
 
 
294 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  28.99 
 
 
208 aa  42.4  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  25.64 
 
 
291 aa  42.4  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3588  putative cyclase  28.85 
 
 
221 aa  42.4  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2165  arylformamidase  28.22 
 
 
209 aa  42  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267222  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  30.3 
 
 
213 aa  42  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  24.5 
 
 
209 aa  41.6  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  27.85 
 
 
204 aa  41.6  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0760  hypothetical protein  25.91 
 
 
209 aa  41.6  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  35.62 
 
 
292 aa  41.6  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>